Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ2

HPSE2, Inactive heparanase-2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSE2Q8WWQ2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HPSE2Q8WWQ2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPSE2Q8WWQ2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPSE2Q8WWQ2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPSE2Q8WWQ2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPSE2Q8WWQ2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPSE2Q8WWQ2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HPSE2Q8WWQ2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPSE2Q8WWQ2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPSE2Q8WWQ2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPSE2Q8WWQ2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPSE2Q8WWQ2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPSE2Q8WWQ2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPSE2Q8WWQ2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPSE2Q8WWQ2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPSE2Q8WWQ2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPSE2Q8WWQ2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HPSE2Q8WWQ2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HPSE2Q8WWQ2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPSE2Q8WWQ2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPSE2Q8WWQ2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPSE2Q8WWQ2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPSE2Q8WWQ2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPSE2Q8WWQ2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPSE2Q8WWQ2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPSE2Q8WWQ2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPSE2Q8WWQ2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPSE2Q8WWQ2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPSE2Q8WWQ2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPSE2Q8WWQ2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HPSE2Q8WWQ2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPSE2Q8WWQ2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPSE2Q8WWQ2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPSE2Q8WWQ2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPSE2Q8WWQ2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPSE2Q8WWQ2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPSE2Q8WWQ2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPSE2Q8WWQ2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HPSE2Q8WWQ2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPSE2Q8WWQ2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPSE2Q8WWQ2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPSE2Q8WWQ2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HPSE2Q8WWQ2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPSE2Q8WWQ2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPSE2Q8WWQ2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPSE2Q8WWQ2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPSE2Q8WWQ2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPSE2Q8WWQ2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPSE2Q8WWQ2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPSE2Q8WWQ2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HPSE2Q8WWQ2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPSE2Q8WWQ2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPSE2Q8WWQ2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPSE2Q8WWQ2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPSE2Q8WWQ2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPSE2Q8WWQ2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPSE2Q8WWQ2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPSE2Q8WWQ2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPSE2Q8WWQ2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPSE2Q8WWQ2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPSE2Q8WWQ2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPSE2Q8WWQ2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPSE2Q8WWQ2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPSE2Q8WWQ2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPSE2Q8WWQ2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPSE2Q8WWQ2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPSE2Q8WWQ2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPSE2Q8WWQ2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPSE2Q8WWQ2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPSE2Q8WWQ2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPSE2Q8WWQ2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPSE2Q8WWQ2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPSE2Q8WWQ2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPSE2Q8WWQ2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPSE2Q8WWQ2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPSE2Q8WWQ2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPSE2Q8WWQ2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPSE2Q8WWQ2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPSE2Q8WWQ2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPSE2Q8WWQ2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HPSE2Q8WWQ2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPSE2Q8WWQ2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPSE2Q8WWQ2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPSE2Q8WWQ2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPSE2Q8WWQ2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPSE2Q8WWQ2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPSE2Q8WWQ2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPSE2Q8WWQ2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPSE2Q8WWQ2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPSE2Q8WWQ2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPSE2Q8WWQ2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPSE2Q8WWQ2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPSE2Q8WWQ2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPSE2Q8WWQ2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPSE2Q8WWQ2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPSE2Q8WWQ2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HPSE2Q8WWQ2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPSE2Q8WWQ2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPSE2Q8WWQ2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPSE2Q8WWQ2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms