Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
LMO7Q8WWI1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
LMO7Q8WWI1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
LMO7Q8WWI1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
LMO7Q8WWI1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
LMO7Q8WWI1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
LMO7Q8WWI1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
LMO7Q8WWI1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
LMO7Q8WWI1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
LMO7Q8WWI1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
LMO7Q8WWI1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
LMO7Q8WWI1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
LMO7Q8WWI1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
LMO7Q8WWI1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
LMO7Q8WWI1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
LMO7Q8WWI1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
LMO7Q8WWI1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
LMO7Q8WWI1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
LMO7Q8WWI1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
LMO7Q8WWI1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
LMO7Q8WWI1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
LMO7Q8WWI1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
LMO7Q8WWI1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
LMO7Q8WWI1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
LMO7Q8WWI1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
LMO7Q8WWI1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
LMO7Q8WWI1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
LMO7Q8WWI1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
LMO7Q8WWI1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
LMO7Q8WWI1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
LMO7Q8WWI1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LMO7Q8WWI1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
LMO7Q8WWI1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
LMO7Q8WWI1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LMO7Q8WWI1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
LMO7Q8WWI1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LMO7Q8WWI1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
LMO7Q8WWI1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
LMO7Q8WWI1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
LMO7Q8WWI1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
LMO7Q8WWI1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
LMO7Q8WWI1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
LMO7Q8WWI1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LMO7Q8WWI1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LMO7Q8WWI1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
LMO7Q8WWI1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
LMO7Q8WWI1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
LMO7Q8WWI1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
LMO7Q8WWI1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
LMO7Q8WWI1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
LMO7Q8WWI1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
LMO7Q8WWI1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
LMO7Q8WWI1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
LMO7Q8WWI1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
LMO7Q8WWI1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
LMO7Q8WWI1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
LMO7Q8WWI1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
LMO7Q8WWI1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
LMO7Q8WWI1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
LMO7Q8WWI1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
LMO7Q8WWI1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
LMO7Q8WWI1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
LMO7Q8WWI1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LMO7Q8WWI1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
LMO7Q8WWI1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LMO7Q8WWI1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LMO7Q8WWI1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
LMO7Q8WWI1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
LMO7Q8WWI1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
LMO7Q8WWI1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LMO7Q8WWI1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
LMO7Q8WWI1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
LMO7Q8WWI1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
LMO7Q8WWI1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
LMO7Q8WWI1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
LMO7Q8WWI1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
LMO7Q8WWI1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
LMO7Q8WWI1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
LMO7Q8WWI1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
LMO7Q8WWI1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
LMO7Q8WWI1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
LMO7Q8WWI1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
LMO7Q8WWI1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LMO7Q8WWI1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
LMO7Q8WWI1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LMO7Q8WWI1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
LMO7Q8WWI1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
LMO7Q8WWI1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
LMO7Q8WWI1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LMO7Q8WWI1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
LMO7Q8WWI1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LMO7Q8WWI1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
LMO7Q8WWI1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LMO7Q8WWI1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
LMO7Q8WWI1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
LMO7Q8WWI1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
LMO7Q8WWI1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LMO7Q8WWI1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LMO7Q8WWI1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LMO7Q8WWI1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms