Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
U2AF1L4Q8WU68 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
U2AF1L4Q8WU68 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
U2AF1L4Q8WU68 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
U2AF1L4Q8WU68 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
U2AF1L4Q8WU68 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
U2AF1L4Q8WU68 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
U2AF1L4Q8WU68 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
U2AF1L4Q8WU68 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
U2AF1L4Q8WU68 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
U2AF1L4Q8WU68 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
U2AF1L4Q8WU68 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
U2AF1L4Q8WU68 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
U2AF1L4Q8WU68 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
U2AF1L4Q8WU68 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
U2AF1L4Q8WU68 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
U2AF1L4Q8WU68 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
U2AF1L4Q8WU68 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
U2AF1L4Q8WU68 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
U2AF1L4Q8WU68 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
U2AF1L4Q8WU68 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
U2AF1L4Q8WU68 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
U2AF1L4Q8WU68 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
U2AF1L4Q8WU68 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
U2AF1L4Q8WU68 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
U2AF1L4Q8WU68 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
U2AF1L4Q8WU68 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
U2AF1L4Q8WU68 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
U2AF1L4Q8WU68 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
U2AF1L4Q8WU68 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
U2AF1L4Q8WU68 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
U2AF1L4Q8WU68 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
U2AF1L4Q8WU68 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
U2AF1L4Q8WU68 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
U2AF1L4Q8WU68 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
U2AF1L4Q8WU68 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
U2AF1L4Q8WU68 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
U2AF1L4Q8WU68 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
U2AF1L4Q8WU68 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
U2AF1L4Q8WU68 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
U2AF1L4Q8WU68 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
U2AF1L4Q8WU68 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
U2AF1L4Q8WU68 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
U2AF1L4Q8WU68 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
U2AF1L4Q8WU68 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
U2AF1L4Q8WU68 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
U2AF1L4Q8WU68 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
U2AF1L4Q8WU68 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
U2AF1L4Q8WU68 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
U2AF1L4Q8WU68 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
U2AF1L4Q8WU68 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
U2AF1L4Q8WU68 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
U2AF1L4Q8WU68 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
U2AF1L4Q8WU68 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
U2AF1L4Q8WU68 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
U2AF1L4Q8WU68 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
U2AF1L4Q8WU68 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
U2AF1L4Q8WU68 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
U2AF1L4Q8WU68 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29■■■□□ 2.23
U2AF1L4Q8WU68 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
U2AF1L4Q8WU68 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
U2AF1L4Q8WU68 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
U2AF1L4Q8WU68 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29■■■□□ 2.23
U2AF1L4Q8WU68 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
U2AF1L4Q8WU68 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
U2AF1L4Q8WU68 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
U2AF1L4Q8WU68 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
U2AF1L4Q8WU68 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
U2AF1L4Q8WU68 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
U2AF1L4Q8WU68 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
U2AF1L4Q8WU68 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
U2AF1L4Q8WU68 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
U2AF1L4Q8WU68 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
U2AF1L4Q8WU68 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
U2AF1L4Q8WU68 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
U2AF1L4Q8WU68 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
U2AF1L4Q8WU68 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
U2AF1L4Q8WU68 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
U2AF1L4Q8WU68 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
U2AF1L4Q8WU68 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
U2AF1L4Q8WU68 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
U2AF1L4Q8WU68 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
U2AF1L4Q8WU68 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
U2AF1L4Q8WU68 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
U2AF1L4Q8WU68 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
U2AF1L4Q8WU68 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
U2AF1L4Q8WU68 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
U2AF1L4Q8WU68 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
U2AF1L4Q8WU68 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
U2AF1L4Q8WU68 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
U2AF1L4Q8WU68 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
U2AF1L4Q8WU68 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
U2AF1L4Q8WU68 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
U2AF1L4Q8WU68 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
U2AF1L4Q8WU68 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
U2AF1L4Q8WU68 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
U2AF1L4Q8WU68 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
U2AF1L4Q8WU68 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
U2AF1L4Q8WU68 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
U2AF1L4Q8WU68 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms