Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY6

ZFP28, Zinc finger protein 28 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP28Q8NHY6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZFP28Q8NHY6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZFP28Q8NHY6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZFP28Q8NHY6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZFP28Q8NHY6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZFP28Q8NHY6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZFP28Q8NHY6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZFP28Q8NHY6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZFP28Q8NHY6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZFP28Q8NHY6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZFP28Q8NHY6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZFP28Q8NHY6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZFP28Q8NHY6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZFP28Q8NHY6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZFP28Q8NHY6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZFP28Q8NHY6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZFP28Q8NHY6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZFP28Q8NHY6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZFP28Q8NHY6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZFP28Q8NHY6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZFP28Q8NHY6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZFP28Q8NHY6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZFP28Q8NHY6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZFP28Q8NHY6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZFP28Q8NHY6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFP28Q8NHY6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFP28Q8NHY6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFP28Q8NHY6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFP28Q8NHY6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFP28Q8NHY6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFP28Q8NHY6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFP28Q8NHY6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFP28Q8NHY6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFP28Q8NHY6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFP28Q8NHY6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFP28Q8NHY6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFP28Q8NHY6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFP28Q8NHY6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFP28Q8NHY6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFP28Q8NHY6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFP28Q8NHY6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFP28Q8NHY6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZFP28Q8NHY6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZFP28Q8NHY6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZFP28Q8NHY6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFP28Q8NHY6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFP28Q8NHY6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFP28Q8NHY6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFP28Q8NHY6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZFP28Q8NHY6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZFP28Q8NHY6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZFP28Q8NHY6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFP28Q8NHY6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFP28Q8NHY6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFP28Q8NHY6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFP28Q8NHY6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms