Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFK1

GJC3, Gap junction gamma-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC3Q8NFK1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJC3Q8NFK1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJC3Q8NFK1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJC3Q8NFK1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJC3Q8NFK1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJC3Q8NFK1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJC3Q8NFK1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJC3Q8NFK1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GJC3Q8NFK1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJC3Q8NFK1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GJC3Q8NFK1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJC3Q8NFK1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJC3Q8NFK1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJC3Q8NFK1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJC3Q8NFK1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJC3Q8NFK1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJC3Q8NFK1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJC3Q8NFK1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GJC3Q8NFK1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJC3Q8NFK1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJC3Q8NFK1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJC3Q8NFK1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJC3Q8NFK1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJC3Q8NFK1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJC3Q8NFK1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJC3Q8NFK1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJC3Q8NFK1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJC3Q8NFK1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJC3Q8NFK1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJC3Q8NFK1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJC3Q8NFK1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJC3Q8NFK1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJC3Q8NFK1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJC3Q8NFK1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJC3Q8NFK1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJC3Q8NFK1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJC3Q8NFK1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJC3Q8NFK1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJC3Q8NFK1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJC3Q8NFK1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJC3Q8NFK1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJC3Q8NFK1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJC3Q8NFK1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJC3Q8NFK1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJC3Q8NFK1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJC3Q8NFK1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJC3Q8NFK1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJC3Q8NFK1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJC3Q8NFK1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJC3Q8NFK1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJC3Q8NFK1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJC3Q8NFK1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJC3Q8NFK1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJC3Q8NFK1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GJC3Q8NFK1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJC3Q8NFK1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJC3Q8NFK1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJC3Q8NFK1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJC3Q8NFK1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJC3Q8NFK1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJC3Q8NFK1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJC3Q8NFK1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJC3Q8NFK1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJC3Q8NFK1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJC3Q8NFK1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJC3Q8NFK1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJC3Q8NFK1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJC3Q8NFK1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJC3Q8NFK1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJC3Q8NFK1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJC3Q8NFK1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJC3Q8NFK1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJC3Q8NFK1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJC3Q8NFK1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJC3Q8NFK1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJC3Q8NFK1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJC3Q8NFK1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GJC3Q8NFK1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJC3Q8NFK1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJC3Q8NFK1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJC3Q8NFK1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJC3Q8NFK1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJC3Q8NFK1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJC3Q8NFK1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJC3Q8NFK1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJC3Q8NFK1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJC3Q8NFK1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJC3Q8NFK1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJC3Q8NFK1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJC3Q8NFK1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJC3Q8NFK1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJC3Q8NFK1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJC3Q8NFK1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJC3Q8NFK1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GJC3Q8NFK1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJC3Q8NFK1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJC3Q8NFK1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJC3Q8NFK1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJC3Q8NFK1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJC3Q8NFK1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms