Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF4

Putative uncharacterized protein FLJ33307, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8NBF4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8NBF4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8NBF4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8NBF4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8NBF4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8NBF4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8NBF4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8NBF4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8NBF4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8NBF4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8NBF4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8NBF4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8NBF4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8NBF4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8NBF4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8NBF4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8NBF4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8NBF4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8NBF4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8NBF4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8NBF4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8NBF4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8NBF4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8NBF4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8NBF4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8NBF4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8NBF4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8NBF4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8NBF4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8NBF4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8NBF4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8NBF4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8NBF4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8NBF4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8NBF4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8NBF4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8NBF4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8NBF4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8NBF4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8NBF4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8NBF4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8NBF4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8NBF4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8NBF4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8NBF4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8NBF4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8NBF4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8NBF4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8NBF4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8NBF4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8NBF4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8NBF4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8NBF4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8NBF4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8NBF4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8NBF4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8NBF4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8NBF4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8NBF4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8NBF4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8NBF4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8NBF4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8NBF4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8NBF4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8NBF4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8NBF4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8NBF4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8NBF4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8NBF4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8NBF4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8NBF4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8NBF4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8NBF4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8NBF4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8NBF4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8NBF4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8NBF4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8NBF4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8NBF4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8NBF4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8NBF4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8NBF4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8NBF4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8NBF4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8NBF4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8NBF4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8NBF4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8NBF4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8NBF4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8NBF4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8NBF4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8NBF4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8NBF4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8NBF4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8NBF4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8NBF4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8NBF4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8NBF4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8NBF4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8NBF4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms