Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD1Q8N9F7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD1Q8N9F7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD1Q8N9F7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD1Q8N9F7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDPD1Q8N9F7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDPD1Q8N9F7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDPD1Q8N9F7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDPD1Q8N9F7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDPD1Q8N9F7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDPD1Q8N9F7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDPD1Q8N9F7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDPD1Q8N9F7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDPD1Q8N9F7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDPD1Q8N9F7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDPD1Q8N9F7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDPD1Q8N9F7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDPD1Q8N9F7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDPD1Q8N9F7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDPD1Q8N9F7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDPD1Q8N9F7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDPD1Q8N9F7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDPD1Q8N9F7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDPD1Q8N9F7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GDPD1Q8N9F7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD1Q8N9F7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD1Q8N9F7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD1Q8N9F7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD1Q8N9F7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD1Q8N9F7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD1Q8N9F7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD1Q8N9F7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD1Q8N9F7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD1Q8N9F7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD1Q8N9F7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD1Q8N9F7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD1Q8N9F7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD1Q8N9F7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD1Q8N9F7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD1Q8N9F7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDPD1Q8N9F7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDPD1Q8N9F7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDPD1Q8N9F7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDPD1Q8N9F7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDPD1Q8N9F7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDPD1Q8N9F7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDPD1Q8N9F7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDPD1Q8N9F7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDPD1Q8N9F7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDPD1Q8N9F7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDPD1Q8N9F7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDPD1Q8N9F7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDPD1Q8N9F7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDPD1Q8N9F7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDPD1Q8N9F7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDPD1Q8N9F7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDPD1Q8N9F7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDPD1Q8N9F7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GDPD1Q8N9F7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDPD1Q8N9F7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDPD1Q8N9F7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDPD1Q8N9F7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDPD1Q8N9F7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDPD1Q8N9F7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDPD1Q8N9F7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDPD1Q8N9F7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDPD1Q8N9F7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDPD1Q8N9F7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDPD1Q8N9F7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDPD1Q8N9F7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDPD1Q8N9F7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDPD1Q8N9F7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDPD1Q8N9F7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDPD1Q8N9F7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDPD1Q8N9F7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDPD1Q8N9F7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDPD1Q8N9F7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDPD1Q8N9F7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDPD1Q8N9F7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GDPD1Q8N9F7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDPD1Q8N9F7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDPD1Q8N9F7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDPD1Q8N9F7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDPD1Q8N9F7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDPD1Q8N9F7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDPD1Q8N9F7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDPD1Q8N9F7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDPD1Q8N9F7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDPD1Q8N9F7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDPD1Q8N9F7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDPD1Q8N9F7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GDPD1Q8N9F7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDPD1Q8N9F7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDPD1Q8N9F7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDPD1Q8N9F7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDPD1Q8N9F7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDPD1Q8N9F7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDPD1Q8N9F7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDPD1Q8N9F7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDPD1Q8N9F7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms