Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6N3

C1orf52, UPF0690 protein C1orf52, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf52Q8N6N3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf52Q8N6N3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf52Q8N6N3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf52Q8N6N3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf52Q8N6N3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf52Q8N6N3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf52Q8N6N3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf52Q8N6N3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf52Q8N6N3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf52Q8N6N3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf52Q8N6N3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf52Q8N6N3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf52Q8N6N3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf52Q8N6N3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf52Q8N6N3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf52Q8N6N3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf52Q8N6N3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf52Q8N6N3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf52Q8N6N3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf52Q8N6N3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf52Q8N6N3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf52Q8N6N3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf52Q8N6N3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf52Q8N6N3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf52Q8N6N3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf52Q8N6N3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf52Q8N6N3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf52Q8N6N3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf52Q8N6N3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf52Q8N6N3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf52Q8N6N3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf52Q8N6N3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf52Q8N6N3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf52Q8N6N3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf52Q8N6N3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf52Q8N6N3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf52Q8N6N3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf52Q8N6N3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf52Q8N6N3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf52Q8N6N3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf52Q8N6N3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf52Q8N6N3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf52Q8N6N3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf52Q8N6N3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf52Q8N6N3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf52Q8N6N3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf52Q8N6N3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf52Q8N6N3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf52Q8N6N3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf52Q8N6N3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf52Q8N6N3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf52Q8N6N3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf52Q8N6N3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf52Q8N6N3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1orf52Q8N6N3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf52Q8N6N3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf52Q8N6N3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf52Q8N6N3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf52Q8N6N3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf52Q8N6N3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1orf52Q8N6N3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf52Q8N6N3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C1orf52Q8N6N3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf52Q8N6N3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf52Q8N6N3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf52Q8N6N3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf52Q8N6N3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf52Q8N6N3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf52Q8N6N3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf52Q8N6N3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf52Q8N6N3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf52Q8N6N3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf52Q8N6N3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf52Q8N6N3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf52Q8N6N3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf52Q8N6N3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf52Q8N6N3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf52Q8N6N3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf52Q8N6N3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf52Q8N6N3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf52Q8N6N3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf52Q8N6N3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf52Q8N6N3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf52Q8N6N3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf52Q8N6N3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf52Q8N6N3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf52Q8N6N3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf52Q8N6N3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf52Q8N6N3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf52Q8N6N3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf52Q8N6N3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf52Q8N6N3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf52Q8N6N3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf52Q8N6N3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf52Q8N6N3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf52Q8N6N3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf52Q8N6N3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf52Q8N6N3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf52Q8N6N3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf52Q8N6N3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms