Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C6

NIN, Ninein, humanhuman

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINQ8N4C6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NINQ8N4C6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NINQ8N4C6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NINQ8N4C6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NINQ8N4C6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NINQ8N4C6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NINQ8N4C6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NINQ8N4C6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NINQ8N4C6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NINQ8N4C6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NINQ8N4C6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NINQ8N4C6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NINQ8N4C6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NINQ8N4C6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NINQ8N4C6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NINQ8N4C6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NINQ8N4C6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NINQ8N4C6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NINQ8N4C6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NINQ8N4C6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NINQ8N4C6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NINQ8N4C6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NINQ8N4C6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NINQ8N4C6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NINQ8N4C6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NINQ8N4C6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NINQ8N4C6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NINQ8N4C6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NINQ8N4C6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NINQ8N4C6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NINQ8N4C6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NINQ8N4C6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NINQ8N4C6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NINQ8N4C6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NINQ8N4C6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NINQ8N4C6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NINQ8N4C6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NINQ8N4C6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NINQ8N4C6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NINQ8N4C6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NINQ8N4C6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NINQ8N4C6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NINQ8N4C6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NINQ8N4C6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NINQ8N4C6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINQ8N4C6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINQ8N4C6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NINQ8N4C6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NINQ8N4C6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINQ8N4C6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NINQ8N4C6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NINQ8N4C6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NINQ8N4C6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NINQ8N4C6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NINQ8N4C6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NINQ8N4C6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NINQ8N4C6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NINQ8N4C6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NINQ8N4C6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NINQ8N4C6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NINQ8N4C6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NINQ8N4C6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NINQ8N4C6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
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