Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CKAP2LQ8IYA6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CKAP2LQ8IYA6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CKAP2LQ8IYA6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CKAP2LQ8IYA6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CKAP2LQ8IYA6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CKAP2LQ8IYA6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CKAP2LQ8IYA6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CKAP2LQ8IYA6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CKAP2LQ8IYA6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CKAP2LQ8IYA6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CKAP2LQ8IYA6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CKAP2LQ8IYA6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CKAP2LQ8IYA6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CKAP2LQ8IYA6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CKAP2LQ8IYA6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CKAP2LQ8IYA6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CKAP2LQ8IYA6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CKAP2LQ8IYA6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CKAP2LQ8IYA6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CKAP2LQ8IYA6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CKAP2LQ8IYA6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CKAP2LQ8IYA6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CKAP2LQ8IYA6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CKAP2LQ8IYA6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CKAP2LQ8IYA6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CKAP2LQ8IYA6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CKAP2LQ8IYA6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CKAP2LQ8IYA6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CKAP2LQ8IYA6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CKAP2LQ8IYA6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CKAP2LQ8IYA6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CKAP2LQ8IYA6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CKAP2LQ8IYA6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CKAP2LQ8IYA6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CKAP2LQ8IYA6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CKAP2LQ8IYA6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CKAP2LQ8IYA6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CKAP2LQ8IYA6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CKAP2LQ8IYA6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CKAP2LQ8IYA6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CKAP2LQ8IYA6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CKAP2LQ8IYA6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CKAP2LQ8IYA6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CKAP2LQ8IYA6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CKAP2LQ8IYA6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CKAP2LQ8IYA6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CKAP2LQ8IYA6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CKAP2LQ8IYA6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CKAP2LQ8IYA6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CKAP2LQ8IYA6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CKAP2LQ8IYA6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CKAP2LQ8IYA6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CKAP2LQ8IYA6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CKAP2LQ8IYA6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CKAP2LQ8IYA6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CKAP2LQ8IYA6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CKAP2LQ8IYA6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CKAP2LQ8IYA6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CKAP2LQ8IYA6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CKAP2LQ8IYA6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CKAP2LQ8IYA6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CKAP2LQ8IYA6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CKAP2LQ8IYA6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CKAP2LQ8IYA6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CKAP2LQ8IYA6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CKAP2LQ8IYA6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CKAP2LQ8IYA6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CKAP2LQ8IYA6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CKAP2LQ8IYA6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CKAP2LQ8IYA6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CKAP2LQ8IYA6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CKAP2LQ8IYA6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CKAP2LQ8IYA6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CKAP2LQ8IYA6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CKAP2LQ8IYA6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CKAP2LQ8IYA6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CKAP2LQ8IYA6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CKAP2LQ8IYA6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CKAP2LQ8IYA6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CKAP2LQ8IYA6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CKAP2LQ8IYA6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CKAP2LQ8IYA6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CKAP2LQ8IYA6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CKAP2LQ8IYA6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CKAP2LQ8IYA6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CKAP2LQ8IYA6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CKAP2LQ8IYA6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CKAP2LQ8IYA6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CKAP2LQ8IYA6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CKAP2LQ8IYA6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CKAP2LQ8IYA6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CKAP2LQ8IYA6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CKAP2LQ8IYA6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CKAP2LQ8IYA6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CKAP2LQ8IYA6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CKAP2LQ8IYA6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CKAP2LQ8IYA6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CKAP2LQ8IYA6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CKAP2LQ8IYA6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms