Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC50Q8IVM0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC50Q8IVM0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC50Q8IVM0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC50Q8IVM0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC50Q8IVM0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC50Q8IVM0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC50Q8IVM0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC50Q8IVM0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC50Q8IVM0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC50Q8IVM0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC50Q8IVM0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC50Q8IVM0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC50Q8IVM0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC50Q8IVM0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC50Q8IVM0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC50Q8IVM0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC50Q8IVM0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC50Q8IVM0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC50Q8IVM0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC50Q8IVM0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC50Q8IVM0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC50Q8IVM0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC50Q8IVM0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC50Q8IVM0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC50Q8IVM0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC50Q8IVM0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC50Q8IVM0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC50Q8IVM0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC50Q8IVM0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC50Q8IVM0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC50Q8IVM0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC50Q8IVM0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC50Q8IVM0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC50Q8IVM0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC50Q8IVM0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC50Q8IVM0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC50Q8IVM0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC50Q8IVM0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC50Q8IVM0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC50Q8IVM0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC50Q8IVM0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC50Q8IVM0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC50Q8IVM0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC50Q8IVM0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC50Q8IVM0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC50Q8IVM0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC50Q8IVM0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC50Q8IVM0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC50Q8IVM0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC50Q8IVM0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC50Q8IVM0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC50Q8IVM0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC50Q8IVM0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC50Q8IVM0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC50Q8IVM0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC50Q8IVM0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC50Q8IVM0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC50Q8IVM0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC50Q8IVM0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC50Q8IVM0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC50Q8IVM0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC50Q8IVM0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC50Q8IVM0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC50Q8IVM0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC50Q8IVM0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC50Q8IVM0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC50Q8IVM0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC50Q8IVM0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC50Q8IVM0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC50Q8IVM0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC50Q8IVM0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC50Q8IVM0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC50Q8IVM0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC50Q8IVM0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC50Q8IVM0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC50Q8IVM0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC50Q8IVM0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC50Q8IVM0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC50Q8IVM0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC50Q8IVM0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC50Q8IVM0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC50Q8IVM0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC50Q8IVM0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC50Q8IVM0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC50Q8IVM0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC50Q8IVM0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC50Q8IVM0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC50Q8IVM0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC50Q8IVM0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC50Q8IVM0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC50Q8IVM0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC50Q8IVM0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC50Q8IVM0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC50Q8IVM0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC50Q8IVM0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC50Q8IVM0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC50Q8IVM0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC50Q8IVM0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC50Q8IVM0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms