Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
OTOP1Q7RTM1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
OTOP1Q7RTM1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
OTOP1Q7RTM1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
OTOP1Q7RTM1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
OTOP1Q7RTM1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
OTOP1Q7RTM1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
OTOP1Q7RTM1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
OTOP1Q7RTM1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
OTOP1Q7RTM1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
OTOP1Q7RTM1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
OTOP1Q7RTM1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
OTOP1Q7RTM1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
OTOP1Q7RTM1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
OTOP1Q7RTM1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
OTOP1Q7RTM1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
OTOP1Q7RTM1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
OTOP1Q7RTM1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
OTOP1Q7RTM1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
OTOP1Q7RTM1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
OTOP1Q7RTM1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
OTOP1Q7RTM1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
OTOP1Q7RTM1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
OTOP1Q7RTM1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
OTOP1Q7RTM1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
OTOP1Q7RTM1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
OTOP1Q7RTM1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
OTOP1Q7RTM1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
OTOP1Q7RTM1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
OTOP1Q7RTM1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
OTOP1Q7RTM1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
OTOP1Q7RTM1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
OTOP1Q7RTM1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
OTOP1Q7RTM1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
OTOP1Q7RTM1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
OTOP1Q7RTM1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
OTOP1Q7RTM1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
OTOP1Q7RTM1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
OTOP1Q7RTM1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
OTOP1Q7RTM1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
OTOP1Q7RTM1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
OTOP1Q7RTM1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
OTOP1Q7RTM1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
OTOP1Q7RTM1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
OTOP1Q7RTM1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
OTOP1Q7RTM1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
OTOP1Q7RTM1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.33
OTOP1Q7RTM1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
OTOP1Q7RTM1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
OTOP1Q7RTM1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
OTOP1Q7RTM1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
OTOP1Q7RTM1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
OTOP1Q7RTM1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
OTOP1Q7RTM1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
OTOP1Q7RTM1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
OTOP1Q7RTM1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
OTOP1Q7RTM1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
OTOP1Q7RTM1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
OTOP1Q7RTM1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
OTOP1Q7RTM1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
OTOP1Q7RTM1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
OTOP1Q7RTM1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
OTOP1Q7RTM1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
OTOP1Q7RTM1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
OTOP1Q7RTM1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
OTOP1Q7RTM1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
OTOP1Q7RTM1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
OTOP1Q7RTM1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
OTOP1Q7RTM1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
OTOP1Q7RTM1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
OTOP1Q7RTM1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
OTOP1Q7RTM1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
OTOP1Q7RTM1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
OTOP1Q7RTM1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
OTOP1Q7RTM1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
OTOP1Q7RTM1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
OTOP1Q7RTM1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
OTOP1Q7RTM1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
OTOP1Q7RTM1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
OTOP1Q7RTM1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
OTOP1Q7RTM1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
OTOP1Q7RTM1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
OTOP1Q7RTM1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
OTOP1Q7RTM1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
OTOP1Q7RTM1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
OTOP1Q7RTM1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
OTOP1Q7RTM1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
OTOP1Q7RTM1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
OTOP1Q7RTM1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
OTOP1Q7RTM1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
OTOP1Q7RTM1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
OTOP1Q7RTM1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
OTOP1Q7RTM1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
OTOP1Q7RTM1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
OTOP1Q7RTM1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
OTOP1Q7RTM1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
OTOP1Q7RTM1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
OTOP1Q7RTM1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
OTOP1Q7RTM1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
OTOP1Q7RTM1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms