Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SV2BQ7L1I2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SV2BQ7L1I2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SV2BQ7L1I2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SV2BQ7L1I2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SV2BQ7L1I2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SV2BQ7L1I2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SV2BQ7L1I2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SV2BQ7L1I2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SV2BQ7L1I2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SV2BQ7L1I2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SV2BQ7L1I2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SV2BQ7L1I2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SV2BQ7L1I2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SV2BQ7L1I2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SV2BQ7L1I2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SV2BQ7L1I2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SV2BQ7L1I2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SV2BQ7L1I2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SV2BQ7L1I2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SV2BQ7L1I2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SV2BQ7L1I2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SV2BQ7L1I2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SV2BQ7L1I2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SV2BQ7L1I2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SV2BQ7L1I2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SV2BQ7L1I2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SV2BQ7L1I2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SV2BQ7L1I2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SV2BQ7L1I2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SV2BQ7L1I2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SV2BQ7L1I2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SV2BQ7L1I2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SV2BQ7L1I2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SV2BQ7L1I2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SV2BQ7L1I2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SV2BQ7L1I2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SV2BQ7L1I2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SV2BQ7L1I2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SV2BQ7L1I2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SV2BQ7L1I2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SV2BQ7L1I2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SV2BQ7L1I2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SV2BQ7L1I2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SV2BQ7L1I2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SV2BQ7L1I2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SV2BQ7L1I2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SV2BQ7L1I2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SV2BQ7L1I2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SV2BQ7L1I2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SV2BQ7L1I2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SV2BQ7L1I2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SV2BQ7L1I2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SV2BQ7L1I2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SV2BQ7L1I2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SV2BQ7L1I2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SV2BQ7L1I2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SV2BQ7L1I2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SV2BQ7L1I2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SV2BQ7L1I2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SV2BQ7L1I2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SV2BQ7L1I2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SV2BQ7L1I2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SV2BQ7L1I2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SV2BQ7L1I2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SV2BQ7L1I2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SV2BQ7L1I2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SV2BQ7L1I2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SV2BQ7L1I2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SV2BQ7L1I2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SV2BQ7L1I2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SV2BQ7L1I2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SV2BQ7L1I2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SV2BQ7L1I2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SV2BQ7L1I2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SV2BQ7L1I2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SV2BQ7L1I2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SV2BQ7L1I2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SV2BQ7L1I2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SV2BQ7L1I2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SV2BQ7L1I2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SV2BQ7L1I2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SV2BQ7L1I2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SV2BQ7L1I2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SV2BQ7L1I2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SV2BQ7L1I2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SV2BQ7L1I2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SV2BQ7L1I2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SV2BQ7L1I2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SV2BQ7L1I2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SV2BQ7L1I2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SV2BQ7L1I2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SV2BQ7L1I2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SV2BQ7L1I2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SV2BQ7L1I2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SV2BQ7L1I2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SV2BQ7L1I2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SV2BQ7L1I2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SV2BQ7L1I2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SV2BQ7L1I2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms