Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NHLRC1Q6VVB1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NHLRC1Q6VVB1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NHLRC1Q6VVB1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NHLRC1Q6VVB1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NHLRC1Q6VVB1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NHLRC1Q6VVB1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NHLRC1Q6VVB1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NHLRC1Q6VVB1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NHLRC1Q6VVB1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NHLRC1Q6VVB1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NHLRC1Q6VVB1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NHLRC1Q6VVB1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NHLRC1Q6VVB1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NHLRC1Q6VVB1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NHLRC1Q6VVB1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NHLRC1Q6VVB1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NHLRC1Q6VVB1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NHLRC1Q6VVB1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NHLRC1Q6VVB1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NHLRC1Q6VVB1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NHLRC1Q6VVB1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NHLRC1Q6VVB1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NHLRC1Q6VVB1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NHLRC1Q6VVB1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NHLRC1Q6VVB1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NHLRC1Q6VVB1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NHLRC1Q6VVB1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NHLRC1Q6VVB1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NHLRC1Q6VVB1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NHLRC1Q6VVB1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NHLRC1Q6VVB1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NHLRC1Q6VVB1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NHLRC1Q6VVB1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NHLRC1Q6VVB1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NHLRC1Q6VVB1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NHLRC1Q6VVB1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NHLRC1Q6VVB1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NHLRC1Q6VVB1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NHLRC1Q6VVB1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NHLRC1Q6VVB1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NHLRC1Q6VVB1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NHLRC1Q6VVB1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NHLRC1Q6VVB1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NHLRC1Q6VVB1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NHLRC1Q6VVB1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NHLRC1Q6VVB1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NHLRC1Q6VVB1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NHLRC1Q6VVB1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NHLRC1Q6VVB1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NHLRC1Q6VVB1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NHLRC1Q6VVB1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NHLRC1Q6VVB1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NHLRC1Q6VVB1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NHLRC1Q6VVB1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NHLRC1Q6VVB1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NHLRC1Q6VVB1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NHLRC1Q6VVB1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NHLRC1Q6VVB1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NHLRC1Q6VVB1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NHLRC1Q6VVB1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NHLRC1Q6VVB1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NHLRC1Q6VVB1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NHLRC1Q6VVB1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NHLRC1Q6VVB1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NHLRC1Q6VVB1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NHLRC1Q6VVB1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NHLRC1Q6VVB1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NHLRC1Q6VVB1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NHLRC1Q6VVB1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NHLRC1Q6VVB1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NHLRC1Q6VVB1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NHLRC1Q6VVB1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NHLRC1Q6VVB1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NHLRC1Q6VVB1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NHLRC1Q6VVB1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NHLRC1Q6VVB1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NHLRC1Q6VVB1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
NHLRC1Q6VVB1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NHLRC1Q6VVB1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NHLRC1Q6VVB1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NHLRC1Q6VVB1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NHLRC1Q6VVB1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NHLRC1Q6VVB1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NHLRC1Q6VVB1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NHLRC1Q6VVB1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NHLRC1Q6VVB1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NHLRC1Q6VVB1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NHLRC1Q6VVB1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NHLRC1Q6VVB1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NHLRC1Q6VVB1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NHLRC1Q6VVB1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NHLRC1Q6VVB1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NHLRC1Q6VVB1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NHLRC1Q6VVB1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NHLRC1Q6VVB1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NHLRC1Q6VVB1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NHLRC1Q6VVB1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NHLRC1Q6VVB1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NHLRC1Q6VVB1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms