Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
LARP1Q6PKG0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
LARP1Q6PKG0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
LARP1Q6PKG0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
LARP1Q6PKG0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
LARP1Q6PKG0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LARP1Q6PKG0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LARP1Q6PKG0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
LARP1Q6PKG0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LARP1Q6PKG0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
LARP1Q6PKG0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LARP1Q6PKG0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
LARP1Q6PKG0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
LARP1Q6PKG0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LARP1Q6PKG0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LARP1Q6PKG0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
LARP1Q6PKG0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
LARP1Q6PKG0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
LARP1Q6PKG0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
LARP1Q6PKG0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
LARP1Q6PKG0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
LARP1Q6PKG0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
LARP1Q6PKG0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
LARP1Q6PKG0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
LARP1Q6PKG0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
LARP1Q6PKG0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
LARP1Q6PKG0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
LARP1Q6PKG0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
LARP1Q6PKG0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
LARP1Q6PKG0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
LARP1Q6PKG0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LARP1Q6PKG0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LARP1Q6PKG0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LARP1Q6PKG0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
LARP1Q6PKG0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LARP1Q6PKG0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
LARP1Q6PKG0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LARP1Q6PKG0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
LARP1Q6PKG0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
LARP1Q6PKG0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
LARP1Q6PKG0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
LARP1Q6PKG0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.07
LARP1Q6PKG0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LARP1Q6PKG0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
LARP1Q6PKG0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
LARP1Q6PKG0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
LARP1Q6PKG0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
LARP1Q6PKG0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LARP1Q6PKG0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LARP1Q6PKG0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LARP1Q6PKG0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LARP1Q6PKG0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LARP1Q6PKG0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LARP1Q6PKG0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LARP1Q6PKG0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
LARP1Q6PKG0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
LARP1Q6PKG0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LARP1Q6PKG0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
LARP1Q6PKG0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
LARP1Q6PKG0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
LARP1Q6PKG0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
LARP1Q6PKG0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LARP1Q6PKG0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LARP1Q6PKG0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
LARP1Q6PKG0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
LARP1Q6PKG0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LARP1Q6PKG0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LARP1Q6PKG0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LARP1Q6PKG0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LARP1Q6PKG0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LARP1Q6PKG0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LARP1Q6PKG0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LARP1Q6PKG0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
LARP1Q6PKG0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
LARP1Q6PKG0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
LARP1Q6PKG0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
LARP1Q6PKG0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LARP1Q6PKG0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LARP1Q6PKG0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LARP1Q6PKG0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LARP1Q6PKG0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
LARP1Q6PKG0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LARP1Q6PKG0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LARP1Q6PKG0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
LARP1Q6PKG0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
LARP1Q6PKG0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
LARP1Q6PKG0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
LARP1Q6PKG0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
LARP1Q6PKG0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
LARP1Q6PKG0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LARP1Q6PKG0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
LARP1Q6PKG0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LARP1Q6PKG0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
LARP1Q6PKG0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
LARP1Q6PKG0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
LARP1Q6PKG0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
LARP1Q6PKG0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LARP1Q6PKG0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LARP1Q6PKG0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LARP1Q6PKG0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms