Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC27A4Q6P1M0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A4Q6P1M0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A4Q6P1M0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A4Q6P1M0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A4Q6P1M0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A4Q6P1M0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A4Q6P1M0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC27A4Q6P1M0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A4Q6P1M0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A4Q6P1M0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A4Q6P1M0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A4Q6P1M0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC27A4Q6P1M0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A4Q6P1M0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A4Q6P1M0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC27A4Q6P1M0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A4Q6P1M0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A4Q6P1M0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A4Q6P1M0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC27A4Q6P1M0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A4Q6P1M0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A4Q6P1M0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A4Q6P1M0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC27A4Q6P1M0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC27A4Q6P1M0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC27A4Q6P1M0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC27A4Q6P1M0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC27A4Q6P1M0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC27A4Q6P1M0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC27A4Q6P1M0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC27A4Q6P1M0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC27A4Q6P1M0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC27A4Q6P1M0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC27A4Q6P1M0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC27A4Q6P1M0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC27A4Q6P1M0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A4Q6P1M0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A4Q6P1M0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A4Q6P1M0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A4Q6P1M0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A4Q6P1M0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC27A4Q6P1M0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A4Q6P1M0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A4Q6P1M0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A4Q6P1M0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A4Q6P1M0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A4Q6P1M0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A4Q6P1M0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC27A4Q6P1M0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A4Q6P1M0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A4Q6P1M0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A4Q6P1M0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A4Q6P1M0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC27A4Q6P1M0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A4Q6P1M0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A4Q6P1M0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A4Q6P1M0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC27A4Q6P1M0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC27A4Q6P1M0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC27A4Q6P1M0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC27A4Q6P1M0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC27A4Q6P1M0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC27A4Q6P1M0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC27A4Q6P1M0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC27A4Q6P1M0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC27A4Q6P1M0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC27A4Q6P1M0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC27A4Q6P1M0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC27A4Q6P1M0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC27A4Q6P1M0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC27A4Q6P1M0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC27A4Q6P1M0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC27A4Q6P1M0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC27A4Q6P1M0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC27A4Q6P1M0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC27A4Q6P1M0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A4Q6P1M0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC27A4Q6P1M0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A4Q6P1M0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A4Q6P1M0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A4Q6P1M0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A4Q6P1M0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A4Q6P1M0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A4Q6P1M0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A4Q6P1M0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A4Q6P1M0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC27A4Q6P1M0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC27A4Q6P1M0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A4Q6P1M0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A4Q6P1M0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A4Q6P1M0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A4Q6P1M0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A4Q6P1M0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A4Q6P1M0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC27A4Q6P1M0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A4Q6P1M0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A4Q6P1M0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A4Q6P1M0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A4Q6P1M0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms