Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZ36

FAAP20, Fanconi anemia core complex-associated protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20Q6NZ36 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAAP20Q6NZ36 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAAP20Q6NZ36 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAAP20Q6NZ36 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAAP20Q6NZ36 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAAP20Q6NZ36 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAAP20Q6NZ36 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAAP20Q6NZ36 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAAP20Q6NZ36 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAAP20Q6NZ36 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAAP20Q6NZ36 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAAP20Q6NZ36 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAAP20Q6NZ36 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAAP20Q6NZ36 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAAP20Q6NZ36 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAAP20Q6NZ36 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAAP20Q6NZ36 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAAP20Q6NZ36 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAAP20Q6NZ36 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAAP20Q6NZ36 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAAP20Q6NZ36 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAAP20Q6NZ36 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAAP20Q6NZ36 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAAP20Q6NZ36 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAAP20Q6NZ36 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAAP20Q6NZ36 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAAP20Q6NZ36 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FAAP20Q6NZ36 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAAP20Q6NZ36 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAAP20Q6NZ36 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAAP20Q6NZ36 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAAP20Q6NZ36 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAAP20Q6NZ36 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAAP20Q6NZ36 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAAP20Q6NZ36 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAAP20Q6NZ36 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAAP20Q6NZ36 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAAP20Q6NZ36 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAAP20Q6NZ36 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAAP20Q6NZ36 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FAAP20Q6NZ36 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAAP20Q6NZ36 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAAP20Q6NZ36 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FAAP20Q6NZ36 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAAP20Q6NZ36 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAAP20Q6NZ36 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAAP20Q6NZ36 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAAP20Q6NZ36 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAAP20Q6NZ36 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAAP20Q6NZ36 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAAP20Q6NZ36 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAAP20Q6NZ36 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAAP20Q6NZ36 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAAP20Q6NZ36 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAAP20Q6NZ36 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAAP20Q6NZ36 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAAP20Q6NZ36 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAAP20Q6NZ36 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAAP20Q6NZ36 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAAP20Q6NZ36 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAAP20Q6NZ36 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAAP20Q6NZ36 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAAP20Q6NZ36 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAAP20Q6NZ36 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAAP20Q6NZ36 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAAP20Q6NZ36 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAAP20Q6NZ36 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAAP20Q6NZ36 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAAP20Q6NZ36 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAAP20Q6NZ36 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAAP20Q6NZ36 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAAP20Q6NZ36 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAAP20Q6NZ36 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAAP20Q6NZ36 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAAP20Q6NZ36 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAAP20Q6NZ36 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAAP20Q6NZ36 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAAP20Q6NZ36 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAAP20Q6NZ36 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAAP20Q6NZ36 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAAP20Q6NZ36 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAAP20Q6NZ36 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAAP20Q6NZ36 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAAP20Q6NZ36 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAAP20Q6NZ36 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAAP20Q6NZ36 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAAP20Q6NZ36 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAAP20Q6NZ36 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAAP20Q6NZ36 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAAP20Q6NZ36 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAAP20Q6NZ36 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAAP20Q6NZ36 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAAP20Q6NZ36 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAAP20Q6NZ36 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAAP20Q6NZ36 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAAP20Q6NZ36 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAAP20Q6NZ36 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAAP20Q6NZ36 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAAP20Q6NZ36 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAAP20Q6NZ36 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms