Protein–RNA interactions for Protein: Q66PJ3

ARL6IP4, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL6IP4Q66PJ3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARL6IP4Q66PJ3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARL6IP4Q66PJ3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ARL6IP4Q66PJ3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARL6IP4Q66PJ3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARL6IP4Q66PJ3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARL6IP4Q66PJ3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARL6IP4Q66PJ3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARL6IP4Q66PJ3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARL6IP4Q66PJ3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARL6IP4Q66PJ3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARL6IP4Q66PJ3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARL6IP4Q66PJ3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ARL6IP4Q66PJ3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARL6IP4Q66PJ3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARL6IP4Q66PJ3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARL6IP4Q66PJ3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARL6IP4Q66PJ3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARL6IP4Q66PJ3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARL6IP4Q66PJ3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARL6IP4Q66PJ3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARL6IP4Q66PJ3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARL6IP4Q66PJ3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARL6IP4Q66PJ3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARL6IP4Q66PJ3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARL6IP4Q66PJ3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARL6IP4Q66PJ3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARL6IP4Q66PJ3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARL6IP4Q66PJ3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARL6IP4Q66PJ3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ARL6IP4Q66PJ3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARL6IP4Q66PJ3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARL6IP4Q66PJ3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARL6IP4Q66PJ3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARL6IP4Q66PJ3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARL6IP4Q66PJ3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARL6IP4Q66PJ3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARL6IP4Q66PJ3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARL6IP4Q66PJ3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARL6IP4Q66PJ3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARL6IP4Q66PJ3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARL6IP4Q66PJ3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARL6IP4Q66PJ3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARL6IP4Q66PJ3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARL6IP4Q66PJ3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARL6IP4Q66PJ3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARL6IP4Q66PJ3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARL6IP4Q66PJ3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARL6IP4Q66PJ3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ARL6IP4Q66PJ3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ARL6IP4Q66PJ3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARL6IP4Q66PJ3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARL6IP4Q66PJ3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARL6IP4Q66PJ3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARL6IP4Q66PJ3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ARL6IP4Q66PJ3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ARL6IP4Q66PJ3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARL6IP4Q66PJ3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARL6IP4Q66PJ3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARL6IP4Q66PJ3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARL6IP4Q66PJ3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARL6IP4Q66PJ3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARL6IP4Q66PJ3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARL6IP4Q66PJ3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARL6IP4Q66PJ3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARL6IP4Q66PJ3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARL6IP4Q66PJ3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARL6IP4Q66PJ3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARL6IP4Q66PJ3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARL6IP4Q66PJ3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARL6IP4Q66PJ3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARL6IP4Q66PJ3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARL6IP4Q66PJ3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARL6IP4Q66PJ3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARL6IP4Q66PJ3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARL6IP4Q66PJ3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARL6IP4Q66PJ3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARL6IP4Q66PJ3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARL6IP4Q66PJ3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARL6IP4Q66PJ3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARL6IP4Q66PJ3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARL6IP4Q66PJ3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARL6IP4Q66PJ3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARL6IP4Q66PJ3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARL6IP4Q66PJ3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARL6IP4Q66PJ3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARL6IP4Q66PJ3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARL6IP4Q66PJ3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ARL6IP4Q66PJ3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARL6IP4Q66PJ3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARL6IP4Q66PJ3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARL6IP4Q66PJ3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARL6IP4Q66PJ3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARL6IP4Q66PJ3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARL6IP4Q66PJ3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARL6IP4Q66PJ3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARL6IP4Q66PJ3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ARL6IP4Q66PJ3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ARL6IP4Q66PJ3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ARL6IP4Q66PJ3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.9 ms