Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRAGBQ5VZM2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRAGBQ5VZM2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRAGBQ5VZM2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRAGBQ5VZM2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRAGBQ5VZM2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RRAGBQ5VZM2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRAGBQ5VZM2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRAGBQ5VZM2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRAGBQ5VZM2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRAGBQ5VZM2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRAGBQ5VZM2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRAGBQ5VZM2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRAGBQ5VZM2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRAGBQ5VZM2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRAGBQ5VZM2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRAGBQ5VZM2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRAGBQ5VZM2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRAGBQ5VZM2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRAGBQ5VZM2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRAGBQ5VZM2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRAGBQ5VZM2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRAGBQ5VZM2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRAGBQ5VZM2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRAGBQ5VZM2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RRAGBQ5VZM2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRAGBQ5VZM2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRAGBQ5VZM2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRAGBQ5VZM2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRAGBQ5VZM2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRAGBQ5VZM2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRAGBQ5VZM2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRAGBQ5VZM2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRAGBQ5VZM2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRAGBQ5VZM2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRAGBQ5VZM2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRAGBQ5VZM2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRAGBQ5VZM2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRAGBQ5VZM2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRAGBQ5VZM2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RRAGBQ5VZM2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRAGBQ5VZM2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRAGBQ5VZM2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRAGBQ5VZM2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRAGBQ5VZM2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRAGBQ5VZM2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRAGBQ5VZM2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRAGBQ5VZM2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRAGBQ5VZM2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRAGBQ5VZM2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRAGBQ5VZM2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRAGBQ5VZM2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRAGBQ5VZM2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRAGBQ5VZM2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRAGBQ5VZM2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RRAGBQ5VZM2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RRAGBQ5VZM2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RRAGBQ5VZM2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RRAGBQ5VZM2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RRAGBQ5VZM2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRAGBQ5VZM2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRAGBQ5VZM2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRAGBQ5VZM2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRAGBQ5VZM2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRAGBQ5VZM2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRAGBQ5VZM2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRAGBQ5VZM2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRAGBQ5VZM2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRAGBQ5VZM2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRAGBQ5VZM2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRAGBQ5VZM2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRAGBQ5VZM2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRAGBQ5VZM2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRAGBQ5VZM2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRAGBQ5VZM2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRAGBQ5VZM2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RRAGBQ5VZM2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RRAGBQ5VZM2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRAGBQ5VZM2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRAGBQ5VZM2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RRAGBQ5VZM2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRAGBQ5VZM2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRAGBQ5VZM2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRAGBQ5VZM2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRAGBQ5VZM2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRAGBQ5VZM2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRAGBQ5VZM2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RRAGBQ5VZM2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRAGBQ5VZM2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRAGBQ5VZM2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRAGBQ5VZM2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRAGBQ5VZM2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRAGBQ5VZM2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRAGBQ5VZM2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRAGBQ5VZM2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRAGBQ5VZM2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RRAGBQ5VZM2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRAGBQ5VZM2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRAGBQ5VZM2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRAGBQ5VZM2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms