Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SAMD13Q5VXD3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SAMD13Q5VXD3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SAMD13Q5VXD3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SAMD13Q5VXD3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SAMD13Q5VXD3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SAMD13Q5VXD3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD13Q5VXD3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD13Q5VXD3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD13Q5VXD3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD13Q5VXD3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD13Q5VXD3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD13Q5VXD3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD13Q5VXD3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD13Q5VXD3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD13Q5VXD3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD13Q5VXD3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD13Q5VXD3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD13Q5VXD3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD13Q5VXD3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD13Q5VXD3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD13Q5VXD3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD13Q5VXD3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SAMD13Q5VXD3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD13Q5VXD3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD13Q5VXD3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD13Q5VXD3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD13Q5VXD3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD13Q5VXD3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD13Q5VXD3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD13Q5VXD3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAMD13Q5VXD3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAMD13Q5VXD3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAMD13Q5VXD3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAMD13Q5VXD3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAMD13Q5VXD3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAMD13Q5VXD3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAMD13Q5VXD3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAMD13Q5VXD3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD13Q5VXD3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD13Q5VXD3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD13Q5VXD3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD13Q5VXD3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD13Q5VXD3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD13Q5VXD3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD13Q5VXD3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD13Q5VXD3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD13Q5VXD3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD13Q5VXD3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD13Q5VXD3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD13Q5VXD3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD13Q5VXD3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD13Q5VXD3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD13Q5VXD3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SAMD13Q5VXD3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAMD13Q5VXD3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms