Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLIPQ5VWP3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLIPQ5VWP3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLIPQ5VWP3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLIPQ5VWP3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLIPQ5VWP3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLIPQ5VWP3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MLIPQ5VWP3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MLIPQ5VWP3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MLIPQ5VWP3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLIPQ5VWP3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLIPQ5VWP3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLIPQ5VWP3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MLIPQ5VWP3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MLIPQ5VWP3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MLIPQ5VWP3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLIPQ5VWP3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLIPQ5VWP3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLIPQ5VWP3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLIPQ5VWP3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLIPQ5VWP3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MLIPQ5VWP3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MLIPQ5VWP3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MLIPQ5VWP3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MLIPQ5VWP3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MLIPQ5VWP3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MLIPQ5VWP3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MLIPQ5VWP3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MLIPQ5VWP3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MLIPQ5VWP3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MLIPQ5VWP3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MLIPQ5VWP3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MLIPQ5VWP3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLIPQ5VWP3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLIPQ5VWP3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLIPQ5VWP3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLIPQ5VWP3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MLIPQ5VWP3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MLIPQ5VWP3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MLIPQ5VWP3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MLIPQ5VWP3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MLIPQ5VWP3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MLIPQ5VWP3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLIPQ5VWP3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLIPQ5VWP3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLIPQ5VWP3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MLIPQ5VWP3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLIPQ5VWP3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MLIPQ5VWP3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MLIPQ5VWP3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MLIPQ5VWP3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MLIPQ5VWP3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MLIPQ5VWP3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLIPQ5VWP3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MLIPQ5VWP3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLIPQ5VWP3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLIPQ5VWP3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLIPQ5VWP3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLIPQ5VWP3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLIPQ5VWP3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLIPQ5VWP3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MLIPQ5VWP3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MLIPQ5VWP3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MLIPQ5VWP3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MLIPQ5VWP3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MLIPQ5VWP3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms