Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
L1TD1Q5T7N2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
L1TD1Q5T7N2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
L1TD1Q5T7N2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
L1TD1Q5T7N2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
L1TD1Q5T7N2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
L1TD1Q5T7N2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
L1TD1Q5T7N2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
L1TD1Q5T7N2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
L1TD1Q5T7N2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
L1TD1Q5T7N2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
L1TD1Q5T7N2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
L1TD1Q5T7N2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
L1TD1Q5T7N2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
L1TD1Q5T7N2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
L1TD1Q5T7N2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
L1TD1Q5T7N2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
L1TD1Q5T7N2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
L1TD1Q5T7N2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
L1TD1Q5T7N2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
L1TD1Q5T7N2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
L1TD1Q5T7N2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
L1TD1Q5T7N2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
L1TD1Q5T7N2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
L1TD1Q5T7N2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
L1TD1Q5T7N2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
L1TD1Q5T7N2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
L1TD1Q5T7N2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
L1TD1Q5T7N2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
L1TD1Q5T7N2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
L1TD1Q5T7N2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
L1TD1Q5T7N2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
L1TD1Q5T7N2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
L1TD1Q5T7N2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
L1TD1Q5T7N2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
L1TD1Q5T7N2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
L1TD1Q5T7N2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
L1TD1Q5T7N2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
L1TD1Q5T7N2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
L1TD1Q5T7N2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
L1TD1Q5T7N2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
L1TD1Q5T7N2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
L1TD1Q5T7N2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
L1TD1Q5T7N2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
L1TD1Q5T7N2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
L1TD1Q5T7N2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
L1TD1Q5T7N2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
L1TD1Q5T7N2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
L1TD1Q5T7N2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
L1TD1Q5T7N2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
L1TD1Q5T7N2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
L1TD1Q5T7N2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
L1TD1Q5T7N2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
L1TD1Q5T7N2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
L1TD1Q5T7N2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
L1TD1Q5T7N2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
L1TD1Q5T7N2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
L1TD1Q5T7N2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
L1TD1Q5T7N2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
L1TD1Q5T7N2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
L1TD1Q5T7N2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
L1TD1Q5T7N2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
L1TD1Q5T7N2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
L1TD1Q5T7N2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
L1TD1Q5T7N2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
L1TD1Q5T7N2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
L1TD1Q5T7N2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
L1TD1Q5T7N2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
L1TD1Q5T7N2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
L1TD1Q5T7N2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
L1TD1Q5T7N2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
L1TD1Q5T7N2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
L1TD1Q5T7N2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
L1TD1Q5T7N2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
L1TD1Q5T7N2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
L1TD1Q5T7N2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
L1TD1Q5T7N2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
L1TD1Q5T7N2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
L1TD1Q5T7N2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
L1TD1Q5T7N2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
L1TD1Q5T7N2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
L1TD1Q5T7N2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
L1TD1Q5T7N2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
L1TD1Q5T7N2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
L1TD1Q5T7N2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
L1TD1Q5T7N2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
L1TD1Q5T7N2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
L1TD1Q5T7N2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
L1TD1Q5T7N2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
L1TD1Q5T7N2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
L1TD1Q5T7N2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
L1TD1Q5T7N2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
L1TD1Q5T7N2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
L1TD1Q5T7N2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
L1TD1Q5T7N2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
L1TD1Q5T7N2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
L1TD1Q5T7N2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
L1TD1Q5T7N2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
L1TD1Q5T7N2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
L1TD1Q5T7N2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms