Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZD1

C6orf141, Uncharacterized protein C6orf141, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf141Q5SZD1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C6orf141Q5SZD1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C6orf141Q5SZD1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf141Q5SZD1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf141Q5SZD1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf141Q5SZD1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf141Q5SZD1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf141Q5SZD1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C6orf141Q5SZD1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C6orf141Q5SZD1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C6orf141Q5SZD1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C6orf141Q5SZD1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C6orf141Q5SZD1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C6orf141Q5SZD1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C6orf141Q5SZD1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C6orf141Q5SZD1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C6orf141Q5SZD1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C6orf141Q5SZD1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C6orf141Q5SZD1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C6orf141Q5SZD1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C6orf141Q5SZD1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C6orf141Q5SZD1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C6orf141Q5SZD1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf141Q5SZD1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf141Q5SZD1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf141Q5SZD1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf141Q5SZD1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf141Q5SZD1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf141Q5SZD1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf141Q5SZD1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf141Q5SZD1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf141Q5SZD1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf141Q5SZD1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf141Q5SZD1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf141Q5SZD1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf141Q5SZD1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf141Q5SZD1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf141Q5SZD1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf141Q5SZD1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf141Q5SZD1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf141Q5SZD1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf141Q5SZD1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf141Q5SZD1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf141Q5SZD1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf141Q5SZD1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf141Q5SZD1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf141Q5SZD1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf141Q5SZD1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C6orf141Q5SZD1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C6orf141Q5SZD1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C6orf141Q5SZD1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C6orf141Q5SZD1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C6orf141Q5SZD1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C6orf141Q5SZD1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C6orf141Q5SZD1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C6orf141Q5SZD1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C6orf141Q5SZD1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C6orf141Q5SZD1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C6orf141Q5SZD1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C6orf141Q5SZD1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C6orf141Q5SZD1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C6orf141Q5SZD1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C6orf141Q5SZD1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C6orf141Q5SZD1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C6orf141Q5SZD1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C6orf141Q5SZD1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C6orf141Q5SZD1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C6orf141Q5SZD1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C6orf141Q5SZD1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C6orf141Q5SZD1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C6orf141Q5SZD1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C6orf141Q5SZD1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C6orf141Q5SZD1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C6orf141Q5SZD1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C6orf141Q5SZD1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C6orf141Q5SZD1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C6orf141Q5SZD1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C6orf141Q5SZD1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C6orf141Q5SZD1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C6orf141Q5SZD1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C6orf141Q5SZD1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C6orf141Q5SZD1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C6orf141Q5SZD1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C6orf141Q5SZD1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C6orf141Q5SZD1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C6orf141Q5SZD1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C6orf141Q5SZD1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C6orf141Q5SZD1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C6orf141Q5SZD1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C6orf141Q5SZD1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C6orf141Q5SZD1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C6orf141Q5SZD1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C6orf141Q5SZD1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C6orf141Q5SZD1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C6orf141Q5SZD1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C6orf141Q5SZD1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C6orf141Q5SZD1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C6orf141Q5SZD1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C6orf141Q5SZD1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C6orf141Q5SZD1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.4 ms