Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
COL5A1-AS1Q5SY13 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
COL5A1-AS1Q5SY13 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL5A1-AS1Q5SY13 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.2 ms