Protein–RNA interactions for Protein: Q53S58

TMEM177, Transmembrane protein 177, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM177Q53S58 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM177Q53S58 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM177Q53S58 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM177Q53S58 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM177Q53S58 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM177Q53S58 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM177Q53S58 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM177Q53S58 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM177Q53S58 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM177Q53S58 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM177Q53S58 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM177Q53S58 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM177Q53S58 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM177Q53S58 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM177Q53S58 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM177Q53S58 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM177Q53S58 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM177Q53S58 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM177Q53S58 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM177Q53S58 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM177Q53S58 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM177Q53S58 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM177Q53S58 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM177Q53S58 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM177Q53S58 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM177Q53S58 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM177Q53S58 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM177Q53S58 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM177Q53S58 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM177Q53S58 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM177Q53S58 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM177Q53S58 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM177Q53S58 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM177Q53S58 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM177Q53S58 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM177Q53S58 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM177Q53S58 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM177Q53S58 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM177Q53S58 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM177Q53S58 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM177Q53S58 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM177Q53S58 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM177Q53S58 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM177Q53S58 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM177Q53S58 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM177Q53S58 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM177Q53S58 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM177Q53S58 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM177Q53S58 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM177Q53S58 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM177Q53S58 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM177Q53S58 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM177Q53S58 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM177Q53S58 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM177Q53S58 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM177Q53S58 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM177Q53S58 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM177Q53S58 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM177Q53S58 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM177Q53S58 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM177Q53S58 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM177Q53S58 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM177Q53S58 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM177Q53S58 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM177Q53S58 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM177Q53S58 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM177Q53S58 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM177Q53S58 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM177Q53S58 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM177Q53S58 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM177Q53S58 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM177Q53S58 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM177Q53S58 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM177Q53S58 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM177Q53S58 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM177Q53S58 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM177Q53S58 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM177Q53S58 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM177Q53S58 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM177Q53S58 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM177Q53S58 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM177Q53S58 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM177Q53S58 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM177Q53S58 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM177Q53S58 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM177Q53S58 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM177Q53S58 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM177Q53S58 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM177Q53S58 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM177Q53S58 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM177Q53S58 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM177Q53S58 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM177Q53S58 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM177Q53S58 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM177Q53S58 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM177Q53S58 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM177Q53S58 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM177Q53S58 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM177Q53S58 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM177Q53S58 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms