Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL38Q2WGJ6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL38Q2WGJ6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL38Q2WGJ6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL38Q2WGJ6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL38Q2WGJ6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL38Q2WGJ6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL38Q2WGJ6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL38Q2WGJ6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL38Q2WGJ6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL38Q2WGJ6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL38Q2WGJ6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL38Q2WGJ6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL38Q2WGJ6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KLHL38Q2WGJ6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL38Q2WGJ6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL38Q2WGJ6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL38Q2WGJ6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL38Q2WGJ6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL38Q2WGJ6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL38Q2WGJ6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL38Q2WGJ6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL38Q2WGJ6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL38Q2WGJ6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL38Q2WGJ6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL38Q2WGJ6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL38Q2WGJ6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL38Q2WGJ6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL38Q2WGJ6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL38Q2WGJ6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL38Q2WGJ6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL38Q2WGJ6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL38Q2WGJ6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL38Q2WGJ6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL38Q2WGJ6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL38Q2WGJ6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL38Q2WGJ6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL38Q2WGJ6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL38Q2WGJ6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL38Q2WGJ6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL38Q2WGJ6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL38Q2WGJ6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL38Q2WGJ6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL38Q2WGJ6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KLHL38Q2WGJ6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KLHL38Q2WGJ6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL38Q2WGJ6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL38Q2WGJ6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL38Q2WGJ6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL38Q2WGJ6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL38Q2WGJ6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL38Q2WGJ6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL38Q2WGJ6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL38Q2WGJ6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL38Q2WGJ6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL38Q2WGJ6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL38Q2WGJ6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL38Q2WGJ6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL38Q2WGJ6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL38Q2WGJ6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL38Q2WGJ6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL38Q2WGJ6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KLHL38Q2WGJ6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL38Q2WGJ6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL38Q2WGJ6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL38Q2WGJ6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL38Q2WGJ6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL38Q2WGJ6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL38Q2WGJ6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL38Q2WGJ6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL38Q2WGJ6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL38Q2WGJ6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL38Q2WGJ6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL38Q2WGJ6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL38Q2WGJ6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL38Q2WGJ6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL38Q2WGJ6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL38Q2WGJ6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL38Q2WGJ6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL38Q2WGJ6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL38Q2WGJ6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL38Q2WGJ6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL38Q2WGJ6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL38Q2WGJ6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL38Q2WGJ6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL38Q2WGJ6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL38Q2WGJ6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL38Q2WGJ6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL38Q2WGJ6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL38Q2WGJ6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL38Q2WGJ6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL38Q2WGJ6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL38Q2WGJ6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL38Q2WGJ6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL38Q2WGJ6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL38Q2WGJ6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL38Q2WGJ6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL38Q2WGJ6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL38Q2WGJ6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 294.4 ms