Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
LAMA4Q16363 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
LAMA4Q16363 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
LAMA4Q16363 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LAMA4Q16363 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LAMA4Q16363 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LAMA4Q16363 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LAMA4Q16363 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LAMA4Q16363 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LAMA4Q16363 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LAMA4Q16363 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
LAMA4Q16363 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LAMA4Q16363 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LAMA4Q16363 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LAMA4Q16363 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
LAMA4Q16363 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LAMA4Q16363 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LAMA4Q16363 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LAMA4Q16363 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
LAMA4Q16363 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
LAMA4Q16363 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
LAMA4Q16363 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
LAMA4Q16363 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
LAMA4Q16363 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
LAMA4Q16363 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
LAMA4Q16363 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
LAMA4Q16363 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
LAMA4Q16363 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LAMA4Q16363 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LAMA4Q16363 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LAMA4Q16363 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LAMA4Q16363 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LAMA4Q16363 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LAMA4Q16363 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LAMA4Q16363 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LAMA4Q16363 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LAMA4Q16363 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LAMA4Q16363 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
LAMA4Q16363 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.44
LAMA4Q16363 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
LAMA4Q16363 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
LAMA4Q16363 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LAMA4Q16363 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
LAMA4Q16363 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LAMA4Q16363 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LAMA4Q16363 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LAMA4Q16363 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LAMA4Q16363 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
LAMA4Q16363 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LAMA4Q16363 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LAMA4Q16363 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LAMA4Q16363 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LAMA4Q16363 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LAMA4Q16363 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LAMA4Q16363 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LAMA4Q16363 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LAMA4Q16363 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LAMA4Q16363 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LAMA4Q16363 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
LAMA4Q16363 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
LAMA4Q16363 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LAMA4Q16363 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LAMA4Q16363 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LAMA4Q16363 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LAMA4Q16363 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LAMA4Q16363 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
LAMA4Q16363 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LAMA4Q16363 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
LAMA4Q16363 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LAMA4Q16363 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LAMA4Q16363 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LAMA4Q16363 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LAMA4Q16363 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LAMA4Q16363 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LAMA4Q16363 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LAMA4Q16363 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
LAMA4Q16363 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LAMA4Q16363 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
LAMA4Q16363 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LAMA4Q16363 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LAMA4Q16363 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LAMA4Q16363 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LAMA4Q16363 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LAMA4Q16363 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LAMA4Q16363 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LAMA4Q16363 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LAMA4Q16363 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LAMA4Q16363 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LAMA4Q16363 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LAMA4Q16363 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LAMA4Q16363 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LAMA4Q16363 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LAMA4Q16363 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LAMA4Q16363 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LAMA4Q16363 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LAMA4Q16363 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LAMA4Q16363 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LAMA4Q16363 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
LAMA4Q16363 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
LAMA4Q16363 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
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