Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USF2Q15853 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USF2Q15853 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USF2Q15853 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USF2Q15853 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USF2Q15853 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USF2Q15853 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USF2Q15853 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USF2Q15853 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USF2Q15853 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USF2Q15853 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USF2Q15853 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USF2Q15853 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USF2Q15853 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USF2Q15853 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USF2Q15853 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USF2Q15853 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USF2Q15853 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USF2Q15853 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USF2Q15853 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USF2Q15853 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USF2Q15853 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USF2Q15853 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USF2Q15853 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USF2Q15853 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USF2Q15853 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USF2Q15853 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USF2Q15853 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USF2Q15853 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USF2Q15853 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USF2Q15853 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USF2Q15853 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USF2Q15853 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USF2Q15853 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USF2Q15853 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USF2Q15853 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USF2Q15853 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USF2Q15853 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USF2Q15853 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USF2Q15853 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
USF2Q15853 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USF2Q15853 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USF2Q15853 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USF2Q15853 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USF2Q15853 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USF2Q15853 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USF2Q15853 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USF2Q15853 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USF2Q15853 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USF2Q15853 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USF2Q15853 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USF2Q15853 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USF2Q15853 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USF2Q15853 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
USF2Q15853 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USF2Q15853 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USF2Q15853 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USF2Q15853 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USF2Q15853 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
USF2Q15853 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USF2Q15853 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USF2Q15853 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USF2Q15853 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USF2Q15853 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USF2Q15853 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USF2Q15853 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USF2Q15853 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USF2Q15853 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USF2Q15853 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USF2Q15853 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USF2Q15853 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USF2Q15853 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USF2Q15853 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USF2Q15853 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USF2Q15853 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USF2Q15853 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USF2Q15853 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USF2Q15853 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USF2Q15853 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USF2Q15853 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USF2Q15853 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USF2Q15853 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USF2Q15853 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USF2Q15853 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USF2Q15853 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USF2Q15853 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USF2Q15853 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USF2Q15853 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USF2Q15853 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USF2Q15853 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USF2Q15853 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USF2Q15853 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
USF2Q15853 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USF2Q15853 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USF2Q15853 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
USF2Q15853 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USF2Q15853 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USF2Q15853 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USF2Q15853 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USF2Q15853 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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