Protein–RNA interactions for Protein: Q15329

E2F5, Transcription factor E2F5, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F5Q15329 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
E2F5Q15329 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
E2F5Q15329 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E2F5Q15329 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
E2F5Q15329 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
E2F5Q15329 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
E2F5Q15329 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
E2F5Q15329 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
E2F5Q15329 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
E2F5Q15329 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
E2F5Q15329 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
E2F5Q15329 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
E2F5Q15329 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
E2F5Q15329 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
E2F5Q15329 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
E2F5Q15329 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
E2F5Q15329 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
E2F5Q15329 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
E2F5Q15329 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
E2F5Q15329 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
E2F5Q15329 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
E2F5Q15329 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
E2F5Q15329 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
E2F5Q15329 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
E2F5Q15329 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
E2F5Q15329 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
E2F5Q15329 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
E2F5Q15329 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
E2F5Q15329 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
E2F5Q15329 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
E2F5Q15329 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
E2F5Q15329 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
E2F5Q15329 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
E2F5Q15329 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
E2F5Q15329 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
E2F5Q15329 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
E2F5Q15329 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
E2F5Q15329 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
E2F5Q15329 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
E2F5Q15329 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
E2F5Q15329 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
E2F5Q15329 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
E2F5Q15329 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
E2F5Q15329 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
E2F5Q15329 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
E2F5Q15329 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
E2F5Q15329 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
E2F5Q15329 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
E2F5Q15329 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
E2F5Q15329 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
E2F5Q15329 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
E2F5Q15329 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
E2F5Q15329 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
E2F5Q15329 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
E2F5Q15329 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
E2F5Q15329 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
E2F5Q15329 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
E2F5Q15329 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
E2F5Q15329 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
E2F5Q15329 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E2F5Q15329 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E2F5Q15329 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
E2F5Q15329 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
E2F5Q15329 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
E2F5Q15329 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
E2F5Q15329 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
E2F5Q15329 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
E2F5Q15329 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
E2F5Q15329 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
E2F5Q15329 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
E2F5Q15329 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
E2F5Q15329 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
E2F5Q15329 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
E2F5Q15329 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
E2F5Q15329 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
E2F5Q15329 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
E2F5Q15329 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
E2F5Q15329 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
E2F5Q15329 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
E2F5Q15329 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
E2F5Q15329 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
E2F5Q15329 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
E2F5Q15329 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
E2F5Q15329 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
E2F5Q15329 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
E2F5Q15329 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
E2F5Q15329 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
E2F5Q15329 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
E2F5Q15329 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
E2F5Q15329 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
E2F5Q15329 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
E2F5Q15329 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
E2F5Q15329 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
E2F5Q15329 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
E2F5Q15329 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
E2F5Q15329 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
E2F5Q15329 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
E2F5Q15329 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
E2F5Q15329 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
E2F5Q15329 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms