Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB35Q15286 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB35Q15286 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB35Q15286 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB35Q15286 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB35Q15286 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB35Q15286 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB35Q15286 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB35Q15286 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB35Q15286 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB35Q15286 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB35Q15286 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB35Q15286 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB35Q15286 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB35Q15286 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB35Q15286 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB35Q15286 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB35Q15286 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB35Q15286 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB35Q15286 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB35Q15286 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB35Q15286 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB35Q15286 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB35Q15286 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB35Q15286 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB35Q15286 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB35Q15286 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB35Q15286 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB35Q15286 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB35Q15286 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB35Q15286 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB35Q15286 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB35Q15286 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB35Q15286 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB35Q15286 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB35Q15286 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB35Q15286 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB35Q15286 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB35Q15286 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB35Q15286 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB35Q15286 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB35Q15286 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB35Q15286 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB35Q15286 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB35Q15286 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB35Q15286 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB35Q15286 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB35Q15286 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB35Q15286 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB35Q15286 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB35Q15286 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB35Q15286 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB35Q15286 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB35Q15286 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB35Q15286 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB35Q15286 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB35Q15286 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB35Q15286 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB35Q15286 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB35Q15286 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB35Q15286 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB35Q15286 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB35Q15286 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB35Q15286 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB35Q15286 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB35Q15286 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB35Q15286 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB35Q15286 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB35Q15286 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB35Q15286 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB35Q15286 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB35Q15286 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB35Q15286 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB35Q15286 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB35Q15286 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB35Q15286 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB35Q15286 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB35Q15286 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB35Q15286 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB35Q15286 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB35Q15286 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB35Q15286 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB35Q15286 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB35Q15286 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB35Q15286 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB35Q15286 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB35Q15286 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB35Q15286 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB35Q15286 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB35Q15286 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB35Q15286 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB35Q15286 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB35Q15286 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB35Q15286 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB35Q15286 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB35Q15286 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB35Q15286 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB35Q15286 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB35Q15286 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB35Q15286 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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