Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMB3Q13751 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMB3Q13751 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMB3Q13751 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMB3Q13751 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMB3Q13751 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMB3Q13751 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMB3Q13751 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMB3Q13751 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMB3Q13751 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMB3Q13751 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMB3Q13751 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMB3Q13751 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMB3Q13751 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMB3Q13751 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMB3Q13751 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMB3Q13751 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMB3Q13751 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMB3Q13751 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMB3Q13751 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMB3Q13751 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMB3Q13751 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMB3Q13751 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMB3Q13751 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMB3Q13751 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMB3Q13751 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMB3Q13751 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMB3Q13751 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMB3Q13751 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMB3Q13751 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMB3Q13751 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMB3Q13751 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMB3Q13751 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMB3Q13751 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMB3Q13751 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMB3Q13751 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMB3Q13751 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMB3Q13751 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMB3Q13751 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMB3Q13751 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMB3Q13751 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMB3Q13751 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMB3Q13751 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMB3Q13751 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMB3Q13751 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMB3Q13751 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMB3Q13751 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMB3Q13751 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMB3Q13751 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMB3Q13751 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMB3Q13751 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMB3Q13751 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMB3Q13751 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMB3Q13751 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMB3Q13751 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMB3Q13751 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMB3Q13751 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMB3Q13751 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMB3Q13751 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMB3Q13751 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMB3Q13751 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMB3Q13751 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMB3Q13751 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMB3Q13751 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMB3Q13751 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMB3Q13751 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMB3Q13751 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMB3Q13751 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMB3Q13751 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMB3Q13751 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMB3Q13751 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMB3Q13751 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMB3Q13751 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMB3Q13751 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMB3Q13751 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMB3Q13751 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMB3Q13751 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB3Q13751 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB3Q13751 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB3Q13751 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB3Q13751 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB3Q13751 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB3Q13751 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMB3Q13751 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMB3Q13751 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMB3Q13751 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMB3Q13751 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMB3Q13751 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMB3Q13751 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMB3Q13751 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMB3Q13751 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMB3Q13751 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMB3Q13751 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMB3Q13751 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMB3Q13751 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMB3Q13751 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMB3Q13751 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMB3Q13751 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMB3Q13751 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMB3Q13751 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms