Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLAMF1Q13291 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLAMF1Q13291 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLAMF1Q13291 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLAMF1Q13291 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLAMF1Q13291 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLAMF1Q13291 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLAMF1Q13291 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLAMF1Q13291 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLAMF1Q13291 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLAMF1Q13291 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLAMF1Q13291 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLAMF1Q13291 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLAMF1Q13291 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLAMF1Q13291 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLAMF1Q13291 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLAMF1Q13291 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLAMF1Q13291 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLAMF1Q13291 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLAMF1Q13291 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLAMF1Q13291 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLAMF1Q13291 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLAMF1Q13291 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLAMF1Q13291 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLAMF1Q13291 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLAMF1Q13291 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLAMF1Q13291 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLAMF1Q13291 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLAMF1Q13291 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLAMF1Q13291 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLAMF1Q13291 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLAMF1Q13291 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLAMF1Q13291 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLAMF1Q13291 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLAMF1Q13291 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLAMF1Q13291 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLAMF1Q13291 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLAMF1Q13291 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLAMF1Q13291 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLAMF1Q13291 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLAMF1Q13291 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLAMF1Q13291 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLAMF1Q13291 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLAMF1Q13291 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLAMF1Q13291 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLAMF1Q13291 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLAMF1Q13291 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLAMF1Q13291 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLAMF1Q13291 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLAMF1Q13291 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLAMF1Q13291 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLAMF1Q13291 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLAMF1Q13291 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLAMF1Q13291 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLAMF1Q13291 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLAMF1Q13291 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLAMF1Q13291 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLAMF1Q13291 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLAMF1Q13291 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLAMF1Q13291 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLAMF1Q13291 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLAMF1Q13291 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLAMF1Q13291 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLAMF1Q13291 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLAMF1Q13291 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLAMF1Q13291 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms