Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH17Q12864 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH17Q12864 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH17Q12864 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH17Q12864 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH17Q12864 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH17Q12864 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH17Q12864 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH17Q12864 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH17Q12864 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH17Q12864 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH17Q12864 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH17Q12864 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH17Q12864 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH17Q12864 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH17Q12864 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH17Q12864 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH17Q12864 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH17Q12864 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDH17Q12864 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDH17Q12864 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDH17Q12864 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDH17Q12864 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH17Q12864 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH17Q12864 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH17Q12864 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH17Q12864 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH17Q12864 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH17Q12864 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH17Q12864 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH17Q12864 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH17Q12864 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH17Q12864 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH17Q12864 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDH17Q12864 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDH17Q12864 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CDH17Q12864 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDH17Q12864 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDH17Q12864 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH17Q12864 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH17Q12864 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH17Q12864 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH17Q12864 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH17Q12864 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH17Q12864 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH17Q12864 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH17Q12864 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH17Q12864 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH17Q12864 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH17Q12864 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH17Q12864 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH17Q12864 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH17Q12864 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDH17Q12864 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDH17Q12864 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDH17Q12864 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH17Q12864 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH17Q12864 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH17Q12864 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH17Q12864 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH17Q12864 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH17Q12864 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH17Q12864 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH17Q12864 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH17Q12864 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH17Q12864 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH17Q12864 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH17Q12864 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH17Q12864 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH17Q12864 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH17Q12864 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH17Q12864 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH17Q12864 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH17Q12864 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH17Q12864 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH17Q12864 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH17Q12864 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH17Q12864 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH17Q12864 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH17Q12864 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH17Q12864 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH17Q12864 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH17Q12864 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH17Q12864 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH17Q12864 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH17Q12864 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH17Q12864 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH17Q12864 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH17Q12864 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH17Q12864 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH17Q12864 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH17Q12864 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDH17Q12864 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDH17Q12864 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDH17Q12864 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDH17Q12864 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH17Q12864 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH17Q12864 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH17Q12864 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH17Q12864 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
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