Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH3

ACSM2A, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM2AQ08AH3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSM2AQ08AH3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSM2AQ08AH3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSM2AQ08AH3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSM2AQ08AH3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSM2AQ08AH3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSM2AQ08AH3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSM2AQ08AH3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSM2AQ08AH3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSM2AQ08AH3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSM2AQ08AH3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSM2AQ08AH3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSM2AQ08AH3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSM2AQ08AH3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSM2AQ08AH3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSM2AQ08AH3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSM2AQ08AH3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSM2AQ08AH3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSM2AQ08AH3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSM2AQ08AH3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSM2AQ08AH3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSM2AQ08AH3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSM2AQ08AH3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSM2AQ08AH3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSM2AQ08AH3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSM2AQ08AH3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSM2AQ08AH3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSM2AQ08AH3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSM2AQ08AH3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSM2AQ08AH3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSM2AQ08AH3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSM2AQ08AH3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSM2AQ08AH3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSM2AQ08AH3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSM2AQ08AH3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSM2AQ08AH3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACSM2AQ08AH3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACSM2AQ08AH3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACSM2AQ08AH3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACSM2AQ08AH3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACSM2AQ08AH3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACSM2AQ08AH3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACSM2AQ08AH3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACSM2AQ08AH3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSM2AQ08AH3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSM2AQ08AH3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSM2AQ08AH3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSM2AQ08AH3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACSM2AQ08AH3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACSM2AQ08AH3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACSM2AQ08AH3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACSM2AQ08AH3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACSM2AQ08AH3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACSM2AQ08AH3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSM2AQ08AH3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSM2AQ08AH3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSM2AQ08AH3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSM2AQ08AH3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSM2AQ08AH3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSM2AQ08AH3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSM2AQ08AH3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSM2AQ08AH3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSM2AQ08AH3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSM2AQ08AH3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSM2AQ08AH3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSM2AQ08AH3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSM2AQ08AH3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSM2AQ08AH3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSM2AQ08AH3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSM2AQ08AH3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSM2AQ08AH3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSM2AQ08AH3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSM2AQ08AH3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSM2AQ08AH3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACSM2AQ08AH3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSM2AQ08AH3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSM2AQ08AH3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSM2AQ08AH3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSM2AQ08AH3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSM2AQ08AH3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSM2AQ08AH3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSM2AQ08AH3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSM2AQ08AH3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSM2AQ08AH3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSM2AQ08AH3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSM2AQ08AH3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSM2AQ08AH3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSM2AQ08AH3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSM2AQ08AH3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSM2AQ08AH3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSM2AQ08AH3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSM2AQ08AH3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSM2AQ08AH3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSM2AQ08AH3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSM2AQ08AH3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSM2AQ08AH3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSM2AQ08AH3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSM2AQ08AH3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSM2AQ08AH3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSM2AQ08AH3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms