Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM3AP98173 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM3AP98173 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM3AP98173 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM3AP98173 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM3AP98173 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM3AP98173 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM3AP98173 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms