Protein–RNA interactions for Protein: P82673

MRPS35, 28S ribosomal protein S35, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS35P82673 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRPS35P82673 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPS35P82673 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPS35P82673 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPS35P82673 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPS35P82673 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MRPS35P82673 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MRPS35P82673 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MRPS35P82673 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MRPS35P82673 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MRPS35P82673 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPS35P82673 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPS35P82673 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPS35P82673 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPS35P82673 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPS35P82673 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPS35P82673 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPS35P82673 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPS35P82673 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPS35P82673 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPS35P82673 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPS35P82673 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPS35P82673 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPS35P82673 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPS35P82673 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPS35P82673 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPS35P82673 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPS35P82673 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPS35P82673 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MRPS35P82673 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MRPS35P82673 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPS35P82673 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPS35P82673 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPS35P82673 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPS35P82673 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPS35P82673 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPS35P82673 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPS35P82673 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPS35P82673 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPS35P82673 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPS35P82673 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPS35P82673 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPS35P82673 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPS35P82673 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPS35P82673 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPS35P82673 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPS35P82673 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPS35P82673 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPS35P82673 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPS35P82673 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPS35P82673 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPS35P82673 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPS35P82673 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPS35P82673 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPS35P82673 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPS35P82673 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPS35P82673 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPS35P82673 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPS35P82673 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPS35P82673 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPS35P82673 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPS35P82673 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPS35P82673 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPS35P82673 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPS35P82673 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPS35P82673 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPS35P82673 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPS35P82673 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPS35P82673 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPS35P82673 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPS35P82673 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPS35P82673 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPS35P82673 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPS35P82673 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPS35P82673 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPS35P82673 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPS35P82673 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPS35P82673 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPS35P82673 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPS35P82673 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPS35P82673 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPS35P82673 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPS35P82673 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MRPS35P82673 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPS35P82673 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPS35P82673 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPS35P82673 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPS35P82673 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPS35P82673 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPS35P82673 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPS35P82673 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPS35P82673 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPS35P82673 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPS35P82673 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPS35P82673 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPS35P82673 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPS35P82673 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPS35P82673 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPS35P82673 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPS35P82673 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms