Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX1P78414 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX1P78414 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX1P78414 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX1P78414 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX1P78414 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX1P78414 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX1P78414 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX1P78414 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX1P78414 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX1P78414 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX1P78414 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX1P78414 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX1P78414 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX1P78414 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX1P78414 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX1P78414 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX1P78414 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX1P78414 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRX1P78414 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRX1P78414 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRX1P78414 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRX1P78414 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRX1P78414 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IRX1P78414 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IRX1P78414 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX1P78414 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX1P78414 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX1P78414 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX1P78414 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX1P78414 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX1P78414 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX1P78414 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
IRX1P78414 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX1P78414 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX1P78414 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX1P78414 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX1P78414 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX1P78414 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX1P78414 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX1P78414 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX1P78414 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRX1P78414 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX1P78414 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX1P78414 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX1P78414 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRX1P78414 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX1P78414 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRX1P78414 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRX1P78414 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRX1P78414 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRX1P78414 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRX1P78414 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRX1P78414 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IRX1P78414 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX1P78414 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX1P78414 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX1P78414 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX1P78414 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX1P78414 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX1P78414 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRX1P78414 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX1P78414 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX1P78414 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX1P78414 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRX1P78414 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX1P78414 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX1P78414 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX1P78414 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX1P78414 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX1P78414 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRX1P78414 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRX1P78414 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX1P78414 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX1P78414 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX1P78414 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX1P78414 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX1P78414 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX1P78414 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX1P78414 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX1P78414 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX1P78414 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX1P78414 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX1P78414 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX1P78414 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX1P78414 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX1P78414 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX1P78414 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX1P78414 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX1P78414 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX1P78414 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX1P78414 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX1P78414 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX1P78414 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX1P78414 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX1P78414 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX1P78414 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX1P78414 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX1P78414 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRX1P78414 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms