Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3BP2P78314 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3BP2P78314 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3BP2P78314 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3BP2P78314 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3BP2P78314 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3BP2P78314 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3BP2P78314 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3BP2P78314 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3BP2P78314 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3BP2P78314 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3BP2P78314 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3BP2P78314 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2P78314 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2P78314 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2P78314 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2P78314 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2P78314 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2P78314 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2P78314 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2P78314 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2P78314 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2P78314 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2P78314 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2P78314 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2P78314 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2P78314 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2P78314 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2P78314 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2P78314 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2P78314 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2P78314 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2P78314 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2P78314 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2P78314 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2P78314 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3BP2P78314 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3BP2P78314 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3BP2P78314 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3BP2P78314 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3BP2P78314 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3BP2P78314 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3BP2P78314 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3BP2P78314 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3BP2P78314 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3BP2P78314 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SH3BP2P78314 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3BP2P78314 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SH3BP2P78314 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3BP2P78314 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3BP2P78314 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3BP2P78314 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3BP2P78314 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3BP2P78314 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3BP2P78314 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3BP2P78314 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3BP2P78314 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3BP2P78314 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3BP2P78314 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3BP2P78314 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH3BP2P78314 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3BP2P78314 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3BP2P78314 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3BP2P78314 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3BP2P78314 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3BP2P78314 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3BP2P78314 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SH3BP2P78314 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SH3BP2P78314 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3BP2P78314 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms