Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERV-K104P61576 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERV-K104P61576 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERV-K104P61576 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERV-K104P61576 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERV-K104P61576 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERV-K104P61576 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERV-K104P61576 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERV-K104P61576 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERV-K104P61576 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERV-K104P61576 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERV-K104P61576 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HERV-K104P61576 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HERV-K104P61576 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HERV-K104P61576 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HERV-K104P61576 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERV-K104P61576 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERV-K104P61576 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERV-K104P61576 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERV-K104P61576 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERV-K104P61576 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERV-K104P61576 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERV-K104P61576 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERV-K104P61576 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERV-K104P61576 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERV-K104P61576 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERV-K104P61576 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERV-K104P61576 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERV-K104P61576 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERV-K104P61576 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERV-K104P61576 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERV-K104P61576 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERV-K104P61576 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERV-K104P61576 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERV-K104P61576 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERV-K104P61576 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERV-K104P61576 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERV-K104P61576 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERV-K104P61576 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERV-K104P61576 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERV-K104P61576 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERV-K104P61576 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERV-K104P61576 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HERV-K104P61576 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERV-K104P61576 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERV-K104P61576 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERV-K104P61576 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERV-K104P61576 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERV-K104P61576 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERV-K104P61576 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERV-K104P61576 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HERV-K104P61576 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERV-K104P61576 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERV-K104P61576 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERV-K104P61576 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERV-K104P61576 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERV-K104P61576 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERV-K104P61576 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERV-K104P61576 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERV-K104P61576 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERV-K104P61576 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERV-K104P61576 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERV-K104P61576 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERV-K104P61576 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERV-K104P61576 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERV-K104P61576 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERV-K104P61576 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERV-K104P61576 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERV-K104P61576 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERV-K104P61576 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERV-K104P61576 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERV-K104P61576 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERV-K104P61576 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERV-K104P61576 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERV-K104P61576 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERV-K104P61576 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HERV-K104P61576 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERV-K104P61576 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERV-K104P61576 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERV-K104P61576 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERV-K104P61576 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERV-K104P61576 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERV-K104P61576 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HERV-K104P61576 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERV-K104P61576 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HERV-K104P61576 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERV-K104P61576 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERV-K104P61576 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HERV-K104P61576 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERV-K104P61576 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERV-K104P61576 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERV-K104P61576 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERV-K104P61576 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERV-K104P61576 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERV-K104P61576 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERV-K104P61576 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERV-K104P61576 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERV-K104P61576 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERV-K104P61576 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERV-K104P61576 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms