Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
BRPF1P55201 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
BRPF1P55201 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
BRPF1P55201 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
BRPF1P55201 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
BRPF1P55201 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
BRPF1P55201 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
BRPF1P55201 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
BRPF1P55201 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
BRPF1P55201 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
BRPF1P55201 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
BRPF1P55201 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
BRPF1P55201 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
BRPF1P55201 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
BRPF1P55201 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
BRPF1P55201 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
BRPF1P55201 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
BRPF1P55201 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
BRPF1P55201 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
BRPF1P55201 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
BRPF1P55201 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
BRPF1P55201 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
BRPF1P55201 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
BRPF1P55201 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
BRPF1P55201 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
BRPF1P55201 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
BRPF1P55201 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
BRPF1P55201 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
BRPF1P55201 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
BRPF1P55201 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
BRPF1P55201 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
BRPF1P55201 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
BRPF1P55201 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
BRPF1P55201 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
BRPF1P55201 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
BRPF1P55201 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
BRPF1P55201 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
BRPF1P55201 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
BRPF1P55201 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
BRPF1P55201 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
BRPF1P55201 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
BRPF1P55201 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
BRPF1P55201 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
BRPF1P55201 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
BRPF1P55201 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
BRPF1P55201 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
BRPF1P55201 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
BRPF1P55201 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
BRPF1P55201 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
BRPF1P55201 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
BRPF1P55201 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
BRPF1P55201 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
BRPF1P55201 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
BRPF1P55201 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
BRPF1P55201 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
BRPF1P55201 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
BRPF1P55201 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
BRPF1P55201 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
BRPF1P55201 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
BRPF1P55201 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
BRPF1P55201 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
BRPF1P55201 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
BRPF1P55201 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
BRPF1P55201 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
BRPF1P55201 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
BRPF1P55201 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
BRPF1P55201 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
BRPF1P55201 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
BRPF1P55201 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
BRPF1P55201 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
BRPF1P55201 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
BRPF1P55201 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
BRPF1P55201 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
BRPF1P55201 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
BRPF1P55201 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
BRPF1P55201 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
BRPF1P55201 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
BRPF1P55201 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
BRPF1P55201 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
BRPF1P55201 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
BRPF1P55201 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
BRPF1P55201 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
BRPF1P55201 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
BRPF1P55201 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
BRPF1P55201 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
BRPF1P55201 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
BRPF1P55201 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
BRPF1P55201 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
BRPF1P55201 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
BRPF1P55201 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
BRPF1P55201 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
BRPF1P55201 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
BRPF1P55201 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
BRPF1P55201 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
BRPF1P55201 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
BRPF1P55201 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
BRPF1P55201 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
BRPF1P55201 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
BRPF1P55201 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
BRPF1P55201 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms