Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMD4P55036 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMD4P55036 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD4P55036 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD4P55036 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD4P55036 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD4P55036 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD4P55036 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD4P55036 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD4P55036 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD4P55036 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD4P55036 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD4P55036 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD4P55036 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD4P55036 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD4P55036 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD4P55036 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD4P55036 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD4P55036 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD4P55036 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD4P55036 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD4P55036 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD4P55036 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD4P55036 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD4P55036 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD4P55036 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD4P55036 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD4P55036 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD4P55036 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD4P55036 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMD4P55036 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMD4P55036 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD4P55036 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMD4P55036 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMD4P55036 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD4P55036 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD4P55036 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD4P55036 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD4P55036 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD4P55036 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD4P55036 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMD4P55036 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMD4P55036 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD4P55036 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD4P55036 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD4P55036 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD4P55036 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD4P55036 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD4P55036 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD4P55036 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD4P55036 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD4P55036 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD4P55036 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD4P55036 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD4P55036 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD4P55036 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD4P55036 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD4P55036 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD4P55036 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD4P55036 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms