Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LIMK2P53671 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LIMK2P53671 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LIMK2P53671 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LIMK2P53671 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LIMK2P53671 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LIMK2P53671 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIMK2P53671 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIMK2P53671 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIMK2P53671 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LIMK2P53671 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIMK2P53671 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIMK2P53671 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LIMK2P53671 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIMK2P53671 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIMK2P53671 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LIMK2P53671 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LIMK2P53671 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LIMK2P53671 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIMK2P53671 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIMK2P53671 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIMK2P53671 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIMK2P53671 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LIMK2P53671 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LIMK2P53671 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LIMK2P53671 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LIMK2P53671 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LIMK2P53671 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LIMK2P53671 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LIMK2P53671 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LIMK2P53671 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LIMK2P53671 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LIMK2P53671 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LIMK2P53671 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LIMK2P53671 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LIMK2P53671 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LIMK2P53671 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LIMK2P53671 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LIMK2P53671 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LIMK2P53671 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LIMK2P53671 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LIMK2P53671 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LIMK2P53671 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LIMK2P53671 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LIMK2P53671 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LIMK2P53671 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LIMK2P53671 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LIMK2P53671 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LIMK2P53671 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LIMK2P53671 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LIMK2P53671 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LIMK2P53671 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LIMK2P53671 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIMK2P53671 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIMK2P53671 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIMK2P53671 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIMK2P53671 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIMK2P53671 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIMK2P53671 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LIMK2P53671 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LIMK2P53671 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LIMK2P53671 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LIMK2P53671 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LIMK2P53671 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LIMK2P53671 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.2 ms