Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGGT1BP53609 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGGT1BP53609 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PGGT1BP53609 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGGT1BP53609 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGGT1BP53609 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGGT1BP53609 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGGT1BP53609 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGGT1BP53609 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGGT1BP53609 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGGT1BP53609 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGGT1BP53609 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGGT1BP53609 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGGT1BP53609 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGGT1BP53609 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGGT1BP53609 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGGT1BP53609 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGGT1BP53609 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PGGT1BP53609 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGGT1BP53609 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGGT1BP53609 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGGT1BP53609 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGGT1BP53609 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PGGT1BP53609 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGGT1BP53609 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PGGT1BP53609 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PGGT1BP53609 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PGGT1BP53609 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PGGT1BP53609 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PGGT1BP53609 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PGGT1BP53609 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PGGT1BP53609 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGGT1BP53609 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGGT1BP53609 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PGGT1BP53609 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGGT1BP53609 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGGT1BP53609 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGGT1BP53609 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGGT1BP53609 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGGT1BP53609 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGGT1BP53609 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PGGT1BP53609 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PGGT1BP53609 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PGGT1BP53609 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGGT1BP53609 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGGT1BP53609 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGGT1BP53609 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGGT1BP53609 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PGGT1BP53609 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGGT1BP53609 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PGGT1BP53609 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PGGT1BP53609 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PGGT1BP53609 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PGGT1BP53609 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PGGT1BP53609 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PGGT1BP53609 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGGT1BP53609 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGGT1BP53609 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGGT1BP53609 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PGGT1BP53609 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGGT1BP53609 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGGT1BP53609 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGGT1BP53609 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGGT1BP53609 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGGT1BP53609 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGGT1BP53609 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGGT1BP53609 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGGT1BP53609 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PGGT1BP53609 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PGGT1BP53609 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGGT1BP53609 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PGGT1BP53609 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGGT1BP53609 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGGT1BP53609 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGGT1BP53609 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGGT1BP53609 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGGT1BP53609 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGGT1BP53609 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGGT1BP53609 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGGT1BP53609 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGGT1BP53609 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGGT1BP53609 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PGGT1BP53609 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGGT1BP53609 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGGT1BP53609 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGGT1BP53609 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PGGT1BP53609 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGGT1BP53609 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGGT1BP53609 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGGT1BP53609 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGGT1BP53609 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGGT1BP53609 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGGT1BP53609 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGGT1BP53609 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGGT1BP53609 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGGT1BP53609 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGGT1BP53609 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGGT1BP53609 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGGT1BP53609 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGGT1BP53609 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
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