Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FOSBP53539 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FOSBP53539 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FOSBP53539 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
FOSBP53539 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
FOSBP53539 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FOSBP53539 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOSBP53539 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOSBP53539 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOSBP53539 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOSBP53539 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FOSBP53539 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FOSBP53539 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FOSBP53539 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FOSBP53539 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOSBP53539 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FOSBP53539 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FOSBP53539 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FOSBP53539 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FOSBP53539 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FOSBP53539 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FOSBP53539 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FOSBP53539 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FOSBP53539 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FOSBP53539 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FOSBP53539 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FOSBP53539 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FOSBP53539 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FOSBP53539 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FOSBP53539 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
FOSBP53539 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FOSBP53539 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FOSBP53539 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FOSBP53539 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FOSBP53539 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FOSBP53539 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
FOSBP53539 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FOSBP53539 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FOSBP53539 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FOSBP53539 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
FOSBP53539 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FOSBP53539 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FOSBP53539 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FOSBP53539 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FOSBP53539 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FOSBP53539 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
FOSBP53539 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FOSBP53539 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FOSBP53539 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
FOSBP53539 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOSBP53539 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOSBP53539 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOSBP53539 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOSBP53539 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOSBP53539 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOSBP53539 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FOSBP53539 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FOSBP53539 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FOSBP53539 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FOSBP53539 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FOSBP53539 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FOSBP53539 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
FOSBP53539 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOSBP53539 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOSBP53539 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOSBP53539 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOSBP53539 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOSBP53539 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOSBP53539 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOSBP53539 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOSBP53539 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOSBP53539 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOSBP53539 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOSBP53539 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOSBP53539 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOSBP53539 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOSBP53539 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOSBP53539 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOSBP53539 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOSBP53539 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOSBP53539 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOSBP53539 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOSBP53539 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOSBP53539 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOSBP53539 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOSBP53539 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOSBP53539 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOSBP53539 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOSBP53539 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOSBP53539 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOSBP53539 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOSBP53539 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOSBP53539 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOSBP53539 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOSBP53539 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOSBP53539 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FOSBP53539 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FOSBP53539 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FOSBP53539 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FOSBP53539 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms