Protein–RNA interactions for Protein: P52435

POLR2J, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2JP52435 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2JP52435 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2JP52435 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2JP52435 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2JP52435 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2JP52435 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2JP52435 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2JP52435 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2JP52435 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2JP52435 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2JP52435 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2JP52435 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2JP52435 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2JP52435 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2JP52435 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2JP52435 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2JP52435 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2JP52435 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2JP52435 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLR2JP52435 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2JP52435 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2JP52435 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2JP52435 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2JP52435 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2JP52435 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2JP52435 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2JP52435 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2JP52435 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2JP52435 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2JP52435 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2JP52435 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2JP52435 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2JP52435 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2JP52435 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2JP52435 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2JP52435 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2JP52435 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2JP52435 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2JP52435 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2JP52435 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2JP52435 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2JP52435 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2JP52435 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2JP52435 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2JP52435 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR2JP52435 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR2JP52435 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR2JP52435 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2JP52435 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2JP52435 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2JP52435 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2JP52435 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2JP52435 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2JP52435 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2JP52435 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2JP52435 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2JP52435 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2JP52435 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2JP52435 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2JP52435 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2JP52435 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2JP52435 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2JP52435 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2JP52435 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2JP52435 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2JP52435 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2JP52435 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2JP52435 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2JP52435 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2JP52435 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2JP52435 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2JP52435 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2JP52435 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2JP52435 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2JP52435 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2JP52435 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2JP52435 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2JP52435 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLR2JP52435 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLR2JP52435 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLR2JP52435 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLR2JP52435 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2JP52435 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2JP52435 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2JP52435 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2JP52435 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2JP52435 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2JP52435 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2JP52435 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2JP52435 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2JP52435 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2JP52435 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2JP52435 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2JP52435 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2JP52435 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2JP52435 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2JP52435 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2JP52435 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2JP52435 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2JP52435 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms