Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSRP3P50461 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSRP3P50461 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSRP3P50461 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSRP3P50461 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSRP3P50461 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSRP3P50461 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CSRP3P50461 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSRP3P50461 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSRP3P50461 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSRP3P50461 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSRP3P50461 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSRP3P50461 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSRP3P50461 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSRP3P50461 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSRP3P50461 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSRP3P50461 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CSRP3P50461 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRP3P50461 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRP3P50461 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRP3P50461 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRP3P50461 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSRP3P50461 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRP3P50461 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRP3P50461 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSRP3P50461 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRP3P50461 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRP3P50461 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRP3P50461 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSRP3P50461 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRP3P50461 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRP3P50461 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRP3P50461 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CSRP3P50461 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSRP3P50461 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRP3P50461 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRP3P50461 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRP3P50461 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRP3P50461 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRP3P50461 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRP3P50461 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRP3P50461 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRP3P50461 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRP3P50461 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSRP3P50461 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRP3P50461 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRP3P50461 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRP3P50461 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRP3P50461 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRP3P50461 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRP3P50461 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRP3P50461 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRP3P50461 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRP3P50461 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRP3P50461 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRP3P50461 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRP3P50461 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRP3P50461 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRP3P50461 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRP3P50461 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRP3P50461 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRP3P50461 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRP3P50461 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRP3P50461 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRP3P50461 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRP3P50461 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRP3P50461 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRP3P50461 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRP3P50461 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRP3P50461 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRP3P50461 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRP3P50461 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRP3P50461 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRP3P50461 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRP3P50461 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRP3P50461 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRP3P50461 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRP3P50461 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRP3P50461 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRP3P50461 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRP3P50461 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRP3P50461 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRP3P50461 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRP3P50461 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRP3P50461 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRP3P50461 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRP3P50461 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRP3P50461 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRP3P50461 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRP3P50461 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSRP3P50461 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSRP3P50461 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSRP3P50461 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSRP3P50461 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSRP3P50461 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSRP3P50461 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSRP3P50461 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSRP3P50461 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSRP3P50461 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSRP3P50461 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms