Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRP9P49458 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRP9P49458 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRP9P49458 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRP9P49458 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRP9P49458 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRP9P49458 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRP9P49458 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRP9P49458 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRP9P49458 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRP9P49458 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SRP9P49458 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRP9P49458 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRP9P49458 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRP9P49458 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRP9P49458 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRP9P49458 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRP9P49458 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRP9P49458 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRP9P49458 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP9P49458 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP9P49458 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP9P49458 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP9P49458 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP9P49458 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP9P49458 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP9P49458 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP9P49458 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRP9P49458 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRP9P49458 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SRP9P49458 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRP9P49458 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRP9P49458 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRP9P49458 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRP9P49458 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRP9P49458 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRP9P49458 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRP9P49458 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRP9P49458 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRP9P49458 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRP9P49458 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRP9P49458 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRP9P49458 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRP9P49458 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRP9P49458 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRP9P49458 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRP9P49458 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRP9P49458 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRP9P49458 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SRP9P49458 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRP9P49458 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRP9P49458 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRP9P49458 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRP9P49458 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRP9P49458 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRP9P49458 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRP9P49458 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRP9P49458 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRP9P49458 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRP9P49458 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRP9P49458 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP9P49458 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP9P49458 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP9P49458 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP9P49458 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRP9P49458 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP9P49458 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP9P49458 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRP9P49458 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP9P49458 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP9P49458 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP9P49458 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRP9P49458 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRP9P49458 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRP9P49458 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRP9P49458 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRP9P49458 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRP9P49458 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRP9P49458 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRP9P49458 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRP9P49458 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRP9P49458 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP9P49458 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP9P49458 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP9P49458 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP9P49458 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP9P49458 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP9P49458 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP9P49458 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP9P49458 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP9P49458 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP9P49458 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP9P49458 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP9P49458 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP9P49458 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP9P49458 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP9P49458 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP9P49458 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP9P49458 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP9P49458 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms