Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGM4P49221 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGM4P49221 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGM4P49221 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGM4P49221 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGM4P49221 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TGM4P49221 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGM4P49221 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGM4P49221 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGM4P49221 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGM4P49221 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGM4P49221 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGM4P49221 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGM4P49221 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGM4P49221 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGM4P49221 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGM4P49221 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGM4P49221 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGM4P49221 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGM4P49221 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGM4P49221 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TGM4P49221 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGM4P49221 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGM4P49221 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGM4P49221 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGM4P49221 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGM4P49221 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGM4P49221 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TGM4P49221 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TGM4P49221 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TGM4P49221 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TGM4P49221 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGM4P49221 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGM4P49221 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGM4P49221 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGM4P49221 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TGM4P49221 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TGM4P49221 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TGM4P49221 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGM4P49221 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGM4P49221 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGM4P49221 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGM4P49221 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGM4P49221 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGM4P49221 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGM4P49221 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGM4P49221 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGM4P49221 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGM4P49221 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGM4P49221 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGM4P49221 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGM4P49221 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGM4P49221 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGM4P49221 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGM4P49221 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGM4P49221 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGM4P49221 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGM4P49221 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGM4P49221 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGM4P49221 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGM4P49221 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGM4P49221 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGM4P49221 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGM4P49221 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGM4P49221 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGM4P49221 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGM4P49221 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGM4P49221 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TGM4P49221 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGM4P49221 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGM4P49221 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGM4P49221 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGM4P49221 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGM4P49221 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGM4P49221 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGM4P49221 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGM4P49221 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGM4P49221 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGM4P49221 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGM4P49221 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGM4P49221 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGM4P49221 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGM4P49221 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGM4P49221 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGM4P49221 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGM4P49221 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGM4P49221 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGM4P49221 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TGM4P49221 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGM4P49221 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGM4P49221 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGM4P49221 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGM4P49221 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGM4P49221 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGM4P49221 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGM4P49221 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGM4P49221 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGM4P49221 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGM4P49221 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGM4P49221 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms