Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAPPC10P48553 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC10P48553 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC10P48553 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC10P48553 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC10P48553 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC10P48553 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC10P48553 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC10P48553 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC10P48553 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC10P48553 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC10P48553 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC10P48553 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC10P48553 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC10P48553 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC10P48553 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRAPPC10P48553 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRAPPC10P48553 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRAPPC10P48553 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC10P48553 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC10P48553 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAPPC10P48553 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAPPC10P48553 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAPPC10P48553 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAPPC10P48553 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC10P48553 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAPPC10P48553 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAPPC10P48553 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAPPC10P48553 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRAPPC10P48553 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC10P48553 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC10P48553 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC10P48553 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC10P48553 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC10P48553 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC10P48553 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC10P48553 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC10P48553 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRAPPC10P48553 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC10P48553 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC10P48553 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC10P48553 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC10P48553 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC10P48553 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC10P48553 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC10P48553 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC10P48553 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC10P48553 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC10P48553 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC10P48553 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC10P48553 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC10P48553 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC10P48553 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC10P48553 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC10P48553 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC10P48553 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC10P48553 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC10P48553 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC10P48553 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAPPC10P48553 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAPPC10P48553 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAPPC10P48553 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC10P48553 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC10P48553 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC10P48553 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC10P48553 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC10P48553 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC10P48553 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC10P48553 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC10P48553 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC10P48553 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC10P48553 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC10P48553 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC10P48553 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC10P48553 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC10P48553 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC10P48553 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC10P48553 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC10P48553 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC10P48553 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC10P48553 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC10P48553 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC10P48553 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC10P48553 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC10P48553 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAPPC10P48553 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAPPC10P48553 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAPPC10P48553 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC10P48553 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC10P48553 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC10P48553 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC10P48553 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC10P48553 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC10P48553 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC10P48553 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC10P48553 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC10P48553 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC10P48553 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC10P48553 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC10P48553 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms