Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
UTRNP46939 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
UTRNP46939 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
UTRNP46939 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
UTRNP46939 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
UTRNP46939 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
UTRNP46939 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
UTRNP46939 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
UTRNP46939 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
UTRNP46939 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
UTRNP46939 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
UTRNP46939 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
UTRNP46939 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
UTRNP46939 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
UTRNP46939 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
UTRNP46939 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
UTRNP46939 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
UTRNP46939 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
UTRNP46939 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
UTRNP46939 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
UTRNP46939 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
UTRNP46939 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
UTRNP46939 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
UTRNP46939 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
UTRNP46939 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
UTRNP46939 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
UTRNP46939 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
UTRNP46939 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
UTRNP46939 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
UTRNP46939 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
UTRNP46939 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
UTRNP46939 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
UTRNP46939 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
UTRNP46939 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
UTRNP46939 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
UTRNP46939 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
UTRNP46939 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
UTRNP46939 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC31.96■■■□□ 2.71
UTRNP46939 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
UTRNP46939 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
UTRNP46939 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
UTRNP46939 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
UTRNP46939 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
UTRNP46939 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
UTRNP46939 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
UTRNP46939 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
UTRNP46939 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
UTRNP46939 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
UTRNP46939 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
UTRNP46939 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
UTRNP46939 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
UTRNP46939 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
UTRNP46939 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
UTRNP46939 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
UTRNP46939 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
UTRNP46939 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
UTRNP46939 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
UTRNP46939 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
UTRNP46939 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
UTRNP46939 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
UTRNP46939 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
UTRNP46939 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
UTRNP46939 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
UTRNP46939 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
UTRNP46939 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
UTRNP46939 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
UTRNP46939 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
UTRNP46939 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC31.84■■■□□ 2.69
UTRNP46939 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
UTRNP46939 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
UTRNP46939 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
UTRNP46939 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
UTRNP46939 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
UTRNP46939 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
UTRNP46939 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
UTRNP46939 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
UTRNP46939 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
UTRNP46939 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
UTRNP46939 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
UTRNP46939 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
UTRNP46939 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
UTRNP46939 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
UTRNP46939 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
UTRNP46939 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
UTRNP46939 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
UTRNP46939 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
UTRNP46939 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
UTRNP46939 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
UTRNP46939 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
UTRNP46939 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
UTRNP46939 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
UTRNP46939 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
UTRNP46939 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
UTRNP46939 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
UTRNP46939 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
UTRNP46939 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
UTRNP46939 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
UTRNP46939 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
UTRNP46939 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
UTRNP46939 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms